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Definición de metabolismo:
Vet. Sergio Damián Abate, Dr. Mag.–Prof. Adjunto Microbiología-Sede Atlántica - UNRN
Metabolismo microbiano Conjunto de reacciones bioquímicas y procesos fisicoquímicos estrechamente interrelacionados, que ocurren en una célula, y son la base para que ésta pueda realizar todas sus actividades: crecer, reproducirse, mantener sus estructuras, responder a estímulos, etc.
Metabolismo microbiano
Biorremediación
Inoculantes para agricultura
Agroalimentos fermentados
Bioenergía
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Tiene aplicación el estudio de esta temática?
1) Introducción:
Catabolismo Vs Anabolismo: Oxidación Vs Reducción Principios de termodinámica Enzimas
2) Composición química de los microorganismos
3) Clasificación de microorganismos según tipos metabólicos: Según fuente de energía, fuente de carbono, tipo de metabolismo energético intermedio, etc.
Según condiciones de crecimiento: características culturales
4) Medios de cultivo microbianos:
Condiciones que deben reunir Clasificaciones según diferentes criterios
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Metabolismo microbiano
1) Introducción: Catabolismo Vs Anabolismo: Catabolismo y anabolismo ocurren sincrónicamente, respetando las leyes de la termodinámica
Anabolismo:
Catabolismo:
Reacciones endotérmicas, consumen energía, el sustrato tiene menor energía interna que el producto resultante de la reacción. Desde la perspectiva termodinámica se trata de reacciones endotérmicas
Reacciones exotérmicas, liberan energía, el sustrato tiene mayor energía interna que el producto resultante de la reacción. Desde la perspectiva termodinámica se trata de reacciones exotérmicas
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Metabolismo microbiano
1) Introducción: Enzimas: Cual es su función?
Facilitar la realización de una reacción metabólica
Disminuyen la energía de activación necesaria para que ocurra una reacción bioquímica Disminuyen el tiempo necesario para que una reacción bioquímica se produzca
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Metabolismo microbiano
1) Introducción:
Enzimas: Nomenclatura según su actividad Oxidoreductasas: catalizan reacciones de oxidorreducción (redox). Utilizan coenzimas y cofactores (NAD, NADP) que transporten los electrones (hidrogeniones) desde el dador hasta el aceptor final de electrones. Estas coenzimas quedan modificadas en su grado de oxidación al participar de una reacción, y no se sintetizan de nuevo sino que se reciclan participando en reacciones inversas, alternando oxidación con reducción. Ejemplos: deshidrogenasa, peroxidasa.
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Metabolismo microbiano
Transferasas: transfieren grupos activos, obtenidos de la ruptura de ciertas moléculas, a otras sustancias receptoras. Suelen actuar en procesos de interconversión de monosacáridos, aminoácidos, etc. Ejemplos: transaminasas Hisrolasas: catalizan reacciones de hidrólisis: ruptura de enlaces con liberación de elementos y sustitución por moléculas provenientes del agua, como ocurre por ejemplo en la obtención de monómeros a partir de polímeros. Actúan típicamente en el catabolismo. Ejemplos: glucosidasas, lipasas, estearasas. Liasas: catalizan reacciones en las que se eliminan grupos H2O, CO2 y NH3 para formar un doble enlace o añadirse a un doble enlace. Ejemplos: decarboxilasas Isomerasas: actúan sobre determinadas moléculas obteniendo o cambiando de ellas su estado en relación a su isómero, catalizando cambios de posición de un grupo en determinada molécula obteniendo formas isoméricas. Suelen actuar en procesos de interconversión. Ejemplo: isomerasas Ligasas: catalizan la unión de elementos que generan un producto de mayor energía interna (anabolismo), como por ejemplo la síntesis de los enlaces denominados "fuertes" mediante el acoplamiento a moléculas de alto valor energético (fosfatos) al ADP formando ATP Ejemplos: sintetasas
1) Introducción: Oxidación Vs Reducción:
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Metabolismo microbiano
Oxidación:
Reacción mediante la cual un sustrato cede electrones (hidrogeniones), pasando de un estado de mayor energía interna a otro de menor energía interna
Reducción:
Reacción mediante la cual un sustrato recibe electrones (hidrogeniones) pasando de un estado de menor energía interna a uno de mayor energía interna
1) Introducción: Oxidación Vs Reducción:
Intermediarios co-enzimáticos: NAD, FAD
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Metabolismo microbiano
1) Introducción: Oxidación Vs Reducción:
Que hacen los intermediarios co-enzimáticos: NAD, FAD?
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Metabolismo microbiano
2) Composición química de los microorganismos De que están hechas las células, procariotas y eucariotas? Químicamente, y a grandes rasgos, procariotas y eucariotas somos CHONPS
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Metabolismo microbiano
2) Composición química de los microorganismos
Mayoritarios
Carbono: 50 % del peso seco celular. Función en metabolismo energético y elementos estructurales Hidrógeno Constituyen biomoléculas, estabilizando átomos (C y N) Oxígeno: de manera individual o como OH ó H20
Nitrógeno: 12 % del peso seco celular. Función en constitución de proteínas estructurales y enzimáticas AN Fosforo: Función en formación de ADN, en fosfolípidos de membrana citoplasmática, y en moléculas que almacenan energía en enlaces fosfóricos
ATP
Azufre: En aminoácidos y vitaminas, aporta posibilidad de uniones internas dando estructura tridimensional y funcionabilidad
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Metabolismo microbiano
Metabolismo microbiano 2) Composición química de los microorganismos
NO CONFUNDIR !!!!!!!!!!!!!
2) Composición química de los microorganismos
Minoritarios
Magnesio (Mg): Función como estabilizador de proteínas enzimáticas, ribosomas, membranas Calcio (Ca): Función en estabilización de pared celular y espora bacteriana en aquellos que la sintetizan
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Metabolismo microbiano
Potasio (K): Principal catión inorgánico, participa en el potencial de membrana y por ello en la transmisión e interpretación de algunos mensajes, es un cofactor enzimático
Socio (Na): Participa en el potencial de membrana y transmisión de mensajes
Hierro (Fe): Funciona en el sistema de citocromo oxidasa (conjunto de enzimas responsables del transporte de electrones durante el proceso de oxidación por respiración celular) Cloro (Cl): Principal anión inorgánico que participa en la polarización de la membrana citoplasmática, el potencial de acción y la transmisión de mensajes por despolarización
cobalto, cobre, zinc, manganeso, molibdeno, selenio…. Participan como co-factores enzimáticos, y se encuentran en muy bajas concentraciones
2) Composición química de los microorganismos Vet. Sergio Damián Abate, Dr. Mag.–Prof. Adjunto Microbiología-Sede Atlántica - UNRN
Metabolismo microbiano
3) Clasificación de microorganismos según tipos metabólicos:
Según fuente de obtención de energía
Según la fuente de elementos básicos para estructura de biomoléculas
C inorgánico
Vs C orgánico
Según temperatura de crecimiento
Según atmósfera de crecimiento
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Metabolismo microbiano
3) Clasificación de microorganismos según tipos metabólicos: Según su fuente de energía
Quimiótrofos: Obtienen energía a partir de la ruptura de enlaces químicos
Fototrofos:
Actinomycetes Importancia: Compostaje
Rhodopseudomonas (Bradyrhuzobiaceace): bacteria purpura Importancia: Biodeegradacion, formacion de H
Obtienen energía al excitarse por energía lumínica Arthrospira Cianobacterias Importancia: Liberacion de O2 Produccion de Spirulina
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Metabolismo microbiano
3) Clasificación de microorganismos según tipos metabólicos: Según su fuente de carbono Bacterias lácticas Heterótrofos: Obtienen carbono a partir del catabolismo de moléculas orgánicas, son incapaces de usar formas inorgánicas de C
Litotrofos: Son capaces de usar el carbono inorgánico (ej: CO2), e incluirlo en propias biomoléculas durante procesos de biosíntesis
Metanobacterias (Archea)
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Metabolismo microbiano
3) Clasificación de microorganismos según tipos metabólicos: Según el aceptor final de electrones en procesos catabólicos
Metabolismo respiratorio: Obtienen energía eficientemente mediante el catabolismo de biomoléculas, debido a que pueden llegar a oxidar completamente las mismas mediante procesos de respiración (aerobios o anaerobios)
Metabolismo fermentativo: Mediante el catabolismo de biomoléculas obtienen energía deficientemente (queda mucha energía residual en el producto metabólico), debido a que oxidan de manera incompleta dichos sustratos. Solo fermentan, son incapaces de respiración
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Metabolismo microbiano
3) Clasificación de microorganismos según tipos metabólicos: Al integrar los criterios metabólicos anteriores, obtenemos la siguiente clasificación Según la fuente de energía usada
Quimiotrofos
Según la fuente de carbono usada
Quimioheterotrofos
Según aceptor final de electrones durante oxidación
Aerobia
O2
Quimioautotrofos
Fermentación
Respiración
Anaerobia
NO3 – SO4 2 – Fe(III)
Fototrofos
Diferentes fermentaciones Etanol Ac. láctico Ac. acético Ac.propiónico Ac.butírico
Bacterias que oxidan elementos inorgánicos
S Fe CO
Fotoheterotrofos NO Reducen CO2 usando H2O
Bacterias púrpuras del S
Bacterias purpuras no del S
Fotoautotrofos
Reducen CO2 usando H2O
Fotosintesis oxigénica
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Metabolismo microbiano
Fotosintesis anoxigénica
Metabolismo microbiano 3) Clasificación de microorganismos según tipos metabólicos: Interacción de los diferentes tipos de microorganismos según su metabolismo
3) Clasificación de microorganismos según tipos metabólicos: Según características culturales: necesidades o limitaciones gaseosas
Aerobios estrictos Anaerobios facultativos Anaerobios estrictos Anaerobios aerotolerantes Capnófilos Microaerófilos
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Metabolismo microbiano
3) Clasificación de microorganismos según tipos metabólicos: Según características culturales: Temperatura de cultivo
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Metabolismo microbiano
Metabolismo microbiano
CAATABOLISMO
Nutrientes con energía interna
Productos finales: baja energía interna
Productos intermedios: baja energía interna
Liberación de energía interna
H2O NH3 CO2 ATP + HPO4 2NAD+ NADP+ FAD
Transportadores de e y enlaces de energía
aminoácidos
bases nitrogenadas
Proteínas (estructurales, enzimas) Polisacáridos (pared celular) Ácidos nucleicos (ADN, ARNr, ARNm, ARNt)
INSUMOS PARA BIOSINTESIS
ácidos grasos carbohidratos
BIOMOLECULAS CELULARES
Lípidos (membrana celular)
ATP NADH NADPH FADH2
ANABOLISMO
?
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3) Clasificación de microorganismos según tipos metabólicos:
Microorganismos autotrofos Vet. Sergio Damián Abate, Dr. Mag.–Prof. Adjunto Microbiología-Sede Atlántica - UNRN
Metabolismo microbiano
Metabolismo energético: Oxidación incompleta de la glucosa por glucólisis Etapa I: reacciones preparatorias generan 2 G3P a partir de 1 glucosa No hay ni oxidación ni reducción Etapa II: se forman 2 piruvatos y se sintetiza ATP por proceso redox
Etapa III: generación de producto final y ATP por proceso redox
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Metabolismo microbiano
Metabolismo energético: Oxidación completa de la glucosa por glucólisis
Genera como subproducto radicales libres oxidantes altamente reactivos
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Metabolismo microbiano
Metabolismo energético: Oxidación completa de varios sustratos
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Metabolismo microbiano
4) Medios de cultivo microbianos: Deberíamos ser capaces de responder las siguientes preguntas ¿Qué es un medio de cultivo? ¿Qué se entiende por «nutriente microbiano»? Como podrían clasificarse los nutrientes? ¿Qué condiciones debe reunir un medio de cultivo ideal? ¿Qué se debe considerar antes de elegir un medio de cultivo para inocular una muestra de nuestro interés?
¿En qué condiciones debe presentarse un medio de cultivo cualquiera, para ser usado en microbiología? ¿Qué condiciones ajenas al medio de cultivo, pueden condicionar el éxito de un medio para obtener el desarrollo del microorganismo deseado?
¿Cómo se clasifican los medios de cultivo?
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Metabolismo microbiano
4) Medios de cultivo microbianos: Medio de cultivo: Definición Nutrientes de Medios de cultivo: Definición Macronutrientes: Agua Fuentes de carbohidratos Fuentes de aminoácidos y proteínas Minerales y vitaminas Micronutrientes: Elementos traza: minerales Reguladores: Estabilizadores osmóticos
Estabilizadores pH
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Metabolismo microbiano
4) Medios de cultivo microbianos: Como debería ser un medio de cultivo ideal?
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Metabolismo microbiano
Debería garantizar el crecimiento de la totalidad de microorganismos pertenecientes al taxón microbiano que se encuentra en estudio, sin discriminar en función de cepas (algunas cepas si, otras no)
Debería garantizar el crecimiento independientemente del estado metabólico en que se encuentre el microorganismo de interés: evitar falsos negativos por falta de desarrollo de microorganismos que se encuentran en estado viable pero no cultivable Debería inhibir a los microorganismos no deseados sin perjudicar a cualquier cepa perteneciente al taxón microbiano de interés para nuestro estudio o análisis De fácil disponibilidad en cualquier lugar del mundo (accesible para fabricarse en cualquier país), para garantizar la reproducibilidad de cualquier ensayo o análisis (criterio básico del método científico)
Inocuo para el operario y para el ambiente Económico
4) Medios de cultivo microbianos: Que se debe considerar antes de elegir un medio de cultivo, para hacer crecer un microorganismo de nuestro interés?
¿Cuál es nuestra necesidad? ¿Necesitamos saber si «un microorganismo específico» está presente o ausente en una muestra, o necesitamos saber «cual/es» microorganismos están presentes en la muestra? ¿La muestra es naturalmente muy contaminada con microorganismos acompañantes del microorganismo que deseamos estudiar, o es una muestra con escasa contaminación? ¿Los microorganismos podrían encontrarse sometidos a un estrés fisicoquímico, producto de la manipulación o composición de la muestra, pudiendo alcanzar el estado de viable-no cultivable? ¿Necesitamos aislar el microorganismo, o solo determinar su presencia o ausencia?
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Metabolismo microbiano
4) Medios de cultivo microbianos:
¿En qué condiciones debe presentarse un medio de cultivo cualquiera, para ser usado en microbiología?
Estéril Con su potencial nutritivo inalterado por el proceso de esterilización Libre de inhibidores microbianos (restos de detergente de limpieza de material de vidrio, sustancias químicas ambientales, desinfectantes, etc.)
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4) Medios de cultivo microbianos:
Condiciones ambientales que pueden limitar el desarrollo de un cultivo, aunque se cuente con el medio de cultivo adecuado
pH Osmolaridad Temperatura Gases-atmósfera de crecimiento
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4) Medios de cultivo microbianos:
Clasificación Según su estado físico (presencia y concentración de agar) Líquidos (caldos)
Semisólidos
Sólidos
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4) Medios de cultivo microbianos:
Clasificación Según su uso Simples Enriquecidos
De enriquecimiento selectivo Selectivos Diferenciales Selectivo-diferenciales
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4) Medios de cultivo microbianos:
Clasificación Según su origen: Naturales o artificiales Animales, vegetales, mixtos
Según el conocimiento sobre la composición: Naturales Químicamente definidos
Según su condición Medios inertes Medios vivos
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Clasificación de Medios de cultivo microbianos
Según su uso: Vet. Sergio Damián Abate, Dr. Mag.–Prof. Adjunto Microbiología-Sede Atlántica - UNRN
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