Centro Nacional de Referencia de Bacteriología

Informe de vigilancia basada en laboratorio:

Salmonella, Costa Rica, 2013

Período: enero – diciembre 2013 Fecha: 30 de julio de 2014

Resumen En el presente documento se hace un análisis descriptivo de la información clínico-epidemiológica de los pacientes con infecciones por Salmonella confirmadas en el Centro Nacional de Referencia de Bacteriología del INCIENSA (CNRB) en el 2013. Además, dado que estas infecciones en su mayoría se consideran zoonóticas, de transmisión alimentaria, también se presentan los resultados de la vigilancia de Salmonella en muestras de origen no humano en el mismo período.

Disponible en: http://www.inciensa.sa.cr Inciensa, Tres Ríos, Cartago, Costa Rica. Tel. 2279-9911 Ext. 126

Cita sugerida: Bolaños HM, Acuña MT, Tijerino A, Jiménez A, Duarte F, Sánchez LM, Dittel I, Vargas JL, Campos E y Red Nacional de Laboratorios de Bacteriología. Informe de vigilancia basada en laboratorio: “Vigilancia basada en laboratorio de Salmonella, Costa Rica, 2013”. Tres Ríos, Costa Rica: INCIENSA, 2014. Disponible en: http://www.inciensa.sa.cr

Vigilancia basada en laboratorio de Salmonella, Costa Rica, 2013 Centro Nacional de Referencia de Bacteriología – INCIENSA

Vigilancia basada en laboratorio de Salmonella, Costa Rica, 2013 Bolaños HM, Acuña MT, Tijerino A, Jiménez A, Duarte F, Sánchez LM, Dittel I, Vargas JL, Campos E y Red Nacional de Laboratorios de Bacteriología – Costa Rica

Introducción Las infecciones por Salmonella se transmiten al hombre por el consumo de alimentos contaminados con heces humanas o animales. Se consideran zoonóticas, a excepción de las causadas por S. Typhi y S. Paratyphi A. En los últimos años, cada vez con mayor frecuencia se reportan infecciones por Salmonella asociadas al consumo de alimentos contaminados y al contacto con animales de granja y mascotas. La mayoría de las infecciones por Salmonella se presentan como cuadros de gastroenteritis (salmonelosis); sin embargo, también se asocian a infecciones extraintestinales, algunas de las cuales pueden evolucionar a cuadros severos e incluso a la muerte. Debido a que las características clínicas de las infecciones por estas bacterias son indistinguibles de las ocasionadas por otros agentes, para conocer su comportamiento epidemiológico se hace indispensable el diagnóstico de laboratorio y la vigilancia de las serovariedades circulantes. En Costa Rica la salmonelosis, la fiebre tifoidea (S. Typhi) y paratifoidea (S. Paratyphi A, B, C) son enfermedades de notificación obligatoria individual. El diagnóstico de las infecciones por Salmonella lo realizan los laboratorios clínicos de hospitales y áreas de salud, tanto públicos como privados, quienes forman parte de la Red Nacional de Laboratorios de Bacteriología. Estos laboratorios refieren todos los aislamientos de Salmonella al Centro Nacional de Referencia de Bacteriología (CNRB) del INCIENSA para su tipificación y vigilancia de la resistencia a los antibióticos. Lo anterior de conformidad con el Reglamento de Vigilancia de la Salud vigente (Decreto Ejecutivo No. 37.306-S, La Gaceta, 22/10/2012). En el presente documento se hace un análisis descriptivo de la información clínico-epidemiológica de los pacientes con infecciones por Salmonella confirmadas en el CNRB en el 2013. Además, dado que estas infecciones en su mayoría se consideran zoonóticas, de transmisión alimentaria, también se presentan los resultados de la vigilancia de Salmonella en muestras de origen no humano en el mismo período.

Metodología Se hace un análisis descriptivo de la información clínico epidemiológica de los pacientes con infecciones por Salmonella, confirmados en el CNRB entre el 01 de enero y el 31 de diciembre de 2013, a partir de la información incluida en las boletas de solicitud de análisis que acompaña las muestras. Además se incluye la información de los aislamientos de origen no humano que fueron referidos al CNRB en el mismo período por laboratorios ambientales de la Red Nacional1. En el CNRB los aislamientos de Salmonella se tipificaron mediante pruebas bioquímicas convencionales y serológicas, empleando el Esquema Kauffmann White. La vigilancia de la sensibilidad a los antibióticos, en un número de cepas representativas de todas las serovariedades (200 / 235), se realizó por el método Kirby Bauer, empleando los puntos de corte establecidos por la Clinical Laboratory Standards Institute (CLSI, 2013), para antibióticos de uso clínico (entre ellos, trimetoprim-sulfamethoxazole, ciprofloxacina, cefalosporinas de tercera generación) y otros empleados como marcadores de vigilancia (como el ácido nalidíxico). La subtipificación molecular por electroforesis en campo pulsado (PFGE por sus siglas en inglés) se realizó utilizando el protocolo de PulseNet América Latina y Caribe.

1

Laboratorios y establecimientos de salud que refirieron al CNRB muestras y aislamientos en el 2013 (número de aislamientos): A.S. Desamparados 1 – Clínica Dr. Marcial Fallas (n:41), H. Dr. Tony Facio Castro (20), A.S. Pavas (15), H. Nacional de Niños Dr. Carlos Sáenz Herrera (13), H. Dr. Enrique Baltodano Briceño (12), H. México (12), A.S. Santa Bárbara (10), H. Los Chiles (9), H. San Vicente de Paúl (9), H. Guápiles (8), EBAIS Hone Creek (7), H. Dr. Rafael A. Calderón Guardia (7), H. San Juan de Dios (6), Laboratorio Clínico LABIN (7), A.S. Barva (5), H. Ciudad Neilly (4), H. Monseñor Sanabria (4), H. San Carlos (4), A.S. Alajuela Norte – Cl. Dr. Marcial Rodríguez (3), H. Clínica Bíblica (3), A.S. Hatillo – Cl. Dr. Solón Núñez (2), A.S. Palmares (2), H. Hotel La Católica (2), EBAIS Santa Bárbara Centro Este (2), H. CIMA (2), H. Dr. Fernando Escalante Pradilla (2), H. Dr. Max Terán Valls (2), H. San Francisco de Asís (2), A.S. Acosta (1), A.S. Coronado (1), A.S. Goigoechea 2 – Cl. Dr. Jiménez Núñez (1), A.S. Santa Ana (1), A.S. Tibás-Uruca-Merced-Cl. Dr. Clorito Picado (1), A.S. Esparza (1), A.S. Naranjo, A.S. San Pablo, A.S. Talamanca, EBAIS Carmona Urbano (1), EBAIS San Juan (1), H. Dr. Carlos Luis Valverde Vega (1), H. Dr. Max Peralta Jiménez (1), H. Dr. Raúl Blanco Cervantes (1), H. Dr. Tomás Casas Casajús (1), H. Dr. William Allen (1), H. San Rafael de Alajuela (1), H. San Vito de Coto Brus (1), H. Upala (1), OIJ-Morgue Judicial (1), Laboratorio Nacional de Servicios Veterinarios (LANASEVE-SENASA) (47), Centro de Investigación en Nutrición Animal-Universidad de Costa Rica (CINA-UCR), Laboratorio Nacional de Aguas (AyA) (9), Escuela de Medicina Veterinaria-Universidad Nacional (4), empresa privada (13).

Vigilancia basada en laboratorio de Salmonella, Costa Rica, 2013 Centro Nacional de Referencia de Bacteriología – INCIENSA

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Resultados Salmonella en clínica humana En el 2013 el CNRB recibió 235 aislamientos de Salmonella de origen humano para confirmación/tipificación, lográndose identificar un total de 34 serovariedades diferentes, 200 (85%) se recuperaron de heces y 35 (15%) de muestras extraintestinales (incluyendo sangre, orina, secreciones, líquido articular, tejido) (Cuadro 1). No todos los serovares se aislaron de los mismos sitios de aislamiento. Por ejemplo, en el caso de S. Enteritidis, se recibieron aislamientos de todos los sitios (heces, sangre, orina, secreciones, líquido articular y tejido), mientras que los dos aislamientos de S. Dublin se aislaron de sangre (Cuadro 1). Las serovariedades S. Enteritidis, S. Typhimurium, S. Panama, S. Typhimurium var. Copenhagen, S. I 1,4,5,12:i:-, S. Weltevreden, S. Sandiego, S. Javiana y S. London, contabilizaron por el 77% de los aislamientos. Vale la pena llamar la atención que en el 2013 se identificaron dos pacientes con infecciones por S. Paratyphi B var. L (+) tartrato (+), en un caso aislado de sangre y en otro de heces. En este último, la diarrea se asoció a la tenencia de una tortuga mascota, de cuyas heces fue posible aislar la misma bacteria. En el CNRB no se documentaron fiebres entéricas por S. Paratyphi A, B o C ni S. Typhi (Cuadro 1).

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Cuadro 1 Serovariedades de Salmonella identificadas en muestras clínicas de origen humano por sitio de aislamiento, Costa Rica 2013 N: 235

Serovariedad

S. Enteritidis S. Typhimurium S. Panama S. Typhimurium var. Copenhagen S. I 4, [5],12:i:S. Weltevreden S. Sandiego S. Javiana S. London S. Infantis S. Minnesota S. Oranienburg S. Oslo S. Berta S. Muenchen S. Newport S. Virchow S. Bonariensis S. Braenderup S. Derby S. Dublin S. I 50:g,f,p:S. Paratyphi B var. L(+) tartrato (+) S. Pomona S. Poona S. Saintpaul S. I parcialmente serotipificada S. IIIb parcialmente serotipificada S. I 50:z4,z32:S. Give S. Glostrup S. Kentucky S. Shleissheim

Total general

Total de aislamientos

Sitios de aislamiento

Número

%

Heces

Sangre

Orina

Secreción

75 36 18 10 10 10 8 7 7 4 4 4 4 3 3 3 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 1 1 1 1

31,9 15,3 5,5 4,3 4,3 4,3 3,4 3,0 3,0 1,7 1,7 1,7 1,7 1,3 1,3 1,3 1,3 0,9 0,9 0,9 0,9 0,9 0,9 0,9 0,9 0,9 0,9 0,4 0,4 0,4 0,4 0,4 0,4

√ √ √ √ √ √ √ √ √ √ √ √ √ √ √ √ √ √ √ √

√ √

√ √ √

√ √ √

235

100,0

Líquido Tejido articular √

√

√

√

√ √

√ √ √

√ √ √ √ √

√

√ √ √ √ √ √ √

Fuente: Centro Nacional de Referencia de Bacteriología, INCIENSA y Red Nacional de Laboratorios de Bacteriología

Las infecciones por Salmonella, se confirmaron en pacientes procedentes de las siete provincias, siendo el mayor número de cantones de San José (34,5%), Limón (16,6%) y Heredia (13,2%) (Cuadro 2). La cantidad y tipo de serovariedades varió según provincia y cantón.

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Total general

1

1

1 1

7

2

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1

1

1 1

1

1

1

2

1

1

1

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1 1

1 5

8

3

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2

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4

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2 1

1 8

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6 2

1

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3

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2

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1 1 1 1

2 2

75 36 18 10 10 10 8

7

7

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1 1

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4

4

4

4

1 1

3

3

3

3

2

2

2

2

1 1

1 1

2

2

1 1

2

2

2

2

1

1

1

1

1

1

Total general

S. IIIb parcialmente serotipificada

S. Shleissheim

S. Kentucky

S. Glostrup

S. Give

S. I 50:z4,z32:-

S. I parcialmente serotipificada

2

S. Saintpaul

1

S. Poona

S. Pomona

2

S. Paratyphi B var. L(+) tartrato (+)

S. I 50:g,f,p:-

S. Dublin

S. Derby

S. Braenderup

1

S. Bonariensis

2

S. Virchow

1 1

S. Newport

S. Muenchen

1

2

S. Berta

1

1

S. Oslo

7

S. Oranienburg

1

S. Minnesota

4

S. Infantis

3

S. London

1

S. Javiana

S. I 4,[5],12:I:-

S. Typhimurium

S. Enteritidis

San José 35 14 Acosta Alajuelita 1 1 Aserrí 1 Curridabat Desamparados 21 5 Escazú 1 Goigoechea 1 Moravia 1 Perez Zeledón 1 San José 5 6 Santa Ana 1 Tibás Vazquez de Coronado 1 Desconocido 2 1 Limón 4 7 Guácimo 1 Limón 1 3 Matina 1 1 Pococí 1 2 Siquirres Talamanca Desconocido 1 Heredia 19 4 Barva 4 Heredia 2 2 San Pablo 1 Santa Bárbara 8 2 Desconocido 4 Alajuela 7 3 Alajuela 3 Grecia 1 Los Chiles 1 Naranjo Palmares 1 San Carlos 2 Upala 1 Desconocido 1 Puntarenas 2 1 Aguirre Buenos Aires Corredores 1 Coto Brus Esparza Montes de Oro Osa 1 Puntarenas 1 Desconocido Guanacaste 2 Abangares Cañas Carrillo 2 Liberia Nandayure Cartago 2 1 Cartago 1 La Unión 2 Paraíso Turrialba DESCONOCIDA 6 4 Desconocido 6 4

S. Sandiego

S. Typhimurium var. Copenhagen

2

Provincia / Cantón

S. Weltevreden

S. Panama

Cuadro 2 Distribución de los pacientes con infecciones por Salmonella por provincia y cantón de procedencia, según serovariedad, Costa Rica 2013

81 (34,5%) 1 2 1 1 39 3 3 2 1 20 1 2 1 4 39 (16,6%) 2 16 2 7 2 9 1 31 (13,2%) 4 6 2 13 6 28 (11,9%) 6 2 10 1 3 4 1 1 16 (6,8%) 2 1 4 1 1 1 2 3 1 13 (5,5%) 1 1 4 6 1 6 (2,6%) 1 3 1 1 21 (8,9%) 21

235

Fuente: Centro Nacional de Referencia de Bacteriología, INCIENSA y Red Nacional de Laboratorios de Bacteriología Vigilancia basada en laboratorio de Salmonella, Costa Rica, 2013 Centro Nacional de Referencia de Bacteriología – INCIENSA

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Las infecciones por Salmonella se presentaron en todas las edades: 16,2% eran niños menores de 5 años, 15,7 % tenían entre 5 y 19 años, 53,1% de 20 a 64 años, 11,5% mayores de 65 años y en 3,4% se desconocía el dato. De estos, 107 (46%) eran mujeres y 128 (54%) hombres. Al comparar la distribución entre hombres y mujeres de acuerdo a los grupos etáreos, se observaron algunas diferencias; por ejemplo, en los niños de 1 a 4 años, la cantidad de infecciones en hombres duplica lo observado en mujeres. Situación similar ocurre en los pacientes de 35 a 39 años y en los adultos mayores de 65 años. Caso contrario ocurre en los grupos de 25 a 29, 45 a 49 y 55 a 59 años, donde se confirmaron más infecciones en mujeres que en hombres (Gráfico 1). Al analizar el comportamiento de la salmonelosis, su distribución por sexo y grupo etáreo es similar al que se observó para la totalidad de las infecciones por Salmonella (Gráfico 1). Sin embargo, en el caso de las infecciones extraintestinales, si bien es cierto, se confirmaron en todos los grupos de edad, 13 (37%) se presentaron en adultos mayores de 65 años (Gráfico 1). Lo anterior contrasta con lo observado en los casos de salmonelosis donde sólo 14 (7%) se confirmó en este grupo etáreo. Gráfico 1 Distribución de las infecciones por Salmonella por sexo, según grupos de edad, Costa Rica, 2013 20

Todas las infecciones N: 235

18 16 14 12

10 8 6 4 2

0

Número de casos confirmados