Servicio de Salud de Castilla-La Mancha La Patología digital en el trabajo asistencial y en la investigación traslacional. MARCIAL GARCÍA ROJO Coordinador SSII. Hospital General de Ciudad Real Junta Directiva de la SEIS Servicio de Anatomía Patológica

martes 20 de diciembre de 11

Anatomía Patológica

DIAGNÓSTICO TRATAMIENTO PRONÓSTICO

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Introducción Las nuevas tecnologías de la información en Patología (sistemas de información, fotografía digital, microscopía virtual) están permitiendo un trabajo más eficiente en los servicios de Anatomía Patológica. Existe una creciente automatización en la especialidad. La imagen digital de gran calidad permite diagnósticos similares al microscopio. El SESCAM creó en 2004 un Centro de Innovación en Tecnología de la Información (CITI) para Patología.

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Microscopía virtual. Términos Digitalización completa de toda la preparación (whole slide imaging, WSI) Preparación digital = Preparación virtual (virtual slide) Componentes: Escáner (microscopio robotizado) Visor de preparaciones Gestión de imágenes

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Cortes histológicos Las preparaciones convencionales son frágiles, No son permanentes, sobre todo inmunofluorescencia, cristales articulación, … En citología, no es posible distribuir copias.

Área de tejido de unos 25 x 20 mm

VENTAJAS DE PREPARACIÓN VIRTUAL ¡ Pequeños aumentos con calidad extraordinaria. ¡ Mapa dinámico de preparación ¡ Enviar imágenes de mayor resolución recibiendo sólo el área seleccionada. ¡ Grabar y reproducir la trayectoria seguida por el patólogo durante su examen de la preparación o laminilla y ¡ Las imágenes quedan almacenadas permanentemente, y sobre ellas es posible realizar anotaciones que también pueden quedar grabadas.

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Nuevas redes de telepatología Red Europea: Action IC0604: Telepathology Network (EURO-TELEPATH)

http://www.conganat.org/eurotelepath Red de Telepatología de Castilla-La Mancha. Proyecto Serendipia del SESCAM Objetivo común: Crear una herramienta de comunicación interprofesional eficiente entre los departamentos de Patología, utilizando una plataforma web estándar.

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Objetivo de SERENDIPIA Los principales objetivos de Serendipia son: o  Proveer de todo el equipamiento necesario para crear servicios digitales de Anatomía Patológica. o  La creación de una red regional de telepatología. Para conseguir estos objetivos Serendipia se ha basado en las principales guías y estándares médicos.

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Tipos de imágenes

4 3

2 1

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Características de las Virtual Slide

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Hospital General de Ciudad Real’s Aperio images

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Alcance y situación actual Implantación en siete hospitales de la comunidad. Tres son hospitales satélite que dependen de los hospitales de referencia (Áreas clínicas). Situación Actual: o  Suministro de equipamiento informático y dispositivos de adquisición de imágenes. o  SI que interconecta con los diferentes sistemas y dispositivos de adquisición de imágenes. o  Implantación en el hospital de Manzanares. Servicio de Salud de Castilla-La Mancha

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Infraestructura Hospitales Satélites

Hospitales de referencia • 

Lectores de códigos de barras para contenedores, casetes y slide.

•  • 

Sala de autopsias. Estación de Macroscópica.

• 

Sala de videoconferencia.

• 

Escáner > 50 slide.

• 

Almacenamiento (40 TB)

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•  Lectores de códigos de barras. •  Estación de macroscópica. •  Impresora de etiquetas. •  Foto microscopia. •  Escáner > 5 slide. •  Almacenamiento (8 TB)

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Necesidades de Almacenamiento o  Número de muestras por año: 5.000 - 40000. o  Tamaño medio de preparaciones virtuales sin comprimir: 30 GB – 40 GB. o  Media de tamaño por preparaciones virtuales usando JPEG2000 a un aumento de 40X: 0.5 – 4 GB. o  Digitalización de todas las imágenes salvo las preparaciones virtuales.

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Necesidades de Almacenamiento Estimación de Almacenamiento en 4 años: o  Albacete Hosp. (800 camas)

40 Terabytes.

o  Almansa (100 camas)

8 Terabytes.

o  Villarrobledo (100 camas)

8 Terabytes.

o  Alcázar de San Juan (400 camas) o  Tomelloso (100 camas) Servicio de Salud de Castilla-La Mancha

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32 Terabytes. 8 Terabytes. 15

DICOM. Suplemento 122. Fichero único: JPEG2000/JPIP

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Sup145 multi-frame tiling (WG26) Use multi-frame image objects (not object per tile)

Single frame image

Thumbnail Image

Multi-frame image (single object)

Intermediate Image Tiles

Multi-frame image (single object) may include multiple Z-planes, color planes

Baseline Image Tiles

In 1 or more DICOM Series

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Aplicaciones desarrolladas 1. El primero es un SI para el gestionar el flujo de trabajo. Próxima versión: Entorno web

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S.I. de Patología en entorno Web Visualizar fotos y preparaciones digitales Servicio de Salud de Castilla-La Mancha

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Aplicaciones desarrolladas El segundo SI es un portal Web de Telepatología: o  Segunda opinión

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Aplicaciones desarrolladas El segundo SI es un portal Web de Telepatología: o  Foro de consulta

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Aplicaciones desarrolladas El segundo SI es un portal Web de Telepatología: o  Biblioteca pedagógica

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Análisis de imagen

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Componentes •  Integrador: SATEC •  SI de Anatomía Patológica (Novopath à VitroPath)

•  PACS 5.6 (Udiat): JPGEG2000 links (JPIP) •  Aplicación Web J2EE (Satec) •  Servidor y visualizador de imágenes (Aurora) •  Escáner de Virtual slide (Aperio) •  Gestión de usuarios: LDAP, Kerberos Servicio de Salud de Castilla-La Mancha

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Arquitectura Lógica

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Arquitectura: 8 hospitales Publicación de informes e imágenes.

Publicación y anonimización de informes, DICOM y JP2K

Publicación de informes e imágenes.

Servicios Centrales Repositorio imágenes anónimas Segunda opinión y biblioteca pedagógica (incluyendo imágenes)

Usuario Externo

Repositorio JPEG2K

Portal

Foro, segunda opinión, biblioteca pedagógica y escaneos remotos. Inventario e incidencias.

Aurora Image Server Portal

SESCAM

Aurora Image Server PÚBLICO

PACS de Backup PRIVADO JP2K: backup

Consulta Worklist WS

ÁREA CLÍNICA 1

ÁREA PACS: envío backup. Consulta proxy.

CLÍNICA 2

Centro Hospitalario 1 Repositorio imágenes Aperio

Centro Hospitalario 2 HIS

Repositorio imágenes PACS Aperio

Ingestión Imágenes, escaneos locales, consulta de estudios online. Usuario SESCAM

HIS

Repositorio imágenes Aperio

PACS Repositorio imágenes Aperio

Hospital Dependiente 1.1

Usuario SESCAM Repositorio imágenes Aperio

Hospital Dependiente 1.2

PIS

PIS

Portal

Portal

Hospital Nodriza 2 Repositorio imágenes Aperio

Repositorio imágenes Aperio Aurora Image Server

Aurora Image Server

Hospital Nodriza 1 Repositorio (Edificio2) JPEG2K

Repositorio JPEG2K

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Hospital Dependiente 2.1

Hospital Dependiente 2.2

Storage commitment de digitalizaciones remotas

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El S.I. de Patología debe estar integrado con: ¡ Historia clínica electrónica: BBDD pacientes única, petición electrónica, informe en la HCE sin olvidar atención primaria ¡ Dispositivos automáticos del laboratorio ¡ PACS: Servidores de imágenes ¡ Portal de telepatología (telemedicina) ¡ Registro hospitalario de tumores ¡ Biobancos (banco de tumores) ¡ Gestión de calidad ¡ Datawarehouse à Minería de datos

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IHE. Actores y Transacciones

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Hacia una medicina personalizada ¡ Integración SIAP-Gestión de imágenes: IHE ¡ Información incluida en los ficheros de imágenes (metadatos): DICOM ¡ Codificación: SNOMED ¡ Biblioteca de imágenes ¡ Guías clínicas: l  Sistema Bethesda 2001 l  Guía de consenso de la ASCCP l  Guía multidisciplinaria cáncer laringe de Holanda l  Informe AP en el cáncer de mama l  Colegio Americano de Patólogos

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Gestión del conocimiento ¡ Pilares: Informática y patología basada en pruebas ¡ Documentos de organización (manuales, protocolos) ¡ Enlace a BBDD bibliográficas Medline, Web Of Knowlegde ¡ Portal de telepatología ¡ Portal del empleado

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Beneficios del proyecto ¡ Automatizar procesos críticos para optimizarlos y minimizar posibles causas de errores. ¡ Diagnóstico, evaluación terapéutica y pronóstica más rápidos y de más calidad, aspectos especialmente relevantes en los estudios intraoperatorios. ¡ Facilita la consulta intradepartamental y entre diversos especialistas del mismo centro. ¡ Mejor seguimiento del proceso diagnóstico. ¡ Segunda opinión más rápida a los centros de referencia. ¡ Introducir la utilización de herramientas de procesado y análisis de imagen como herramientas de ayuda en el diagnóstico por ordenador en Anatomía Patológica.

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Retos en medicina traslacional Micromatrices de tejido (TMAs) Integración de información genética/molecular Otras modalidades de imagen: Inmunofluorescencia, FISH.

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FISH – Un reto tecnológico

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Conclusiones o  SERENDIPIA es la primera red de telepatología con fines asistenciales o  Inclusión dentro de la HCE (MAMBRINO XXI). o  Mejora la gestión del conocimiento

o  Ayuda a los pacientes a recibir mejores diagnósticos y mejor evaluación pronóstica y a seleccionar las mejores opciones terapéuticas (biomarcadores). o  Interconexión con otras redes de telepatología.

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http://www.telepathology2010.com

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Muchas gracias.

[email protected]

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