3rd USA-Mexico Workshop in Biological Chemistry: Protein Folding, Dynamics and Function Cuarto Congreso de la Rama de Fisicoquímica, Estructura y Diseño de Proteínas de la Sociedad Mexicana de Bioquímica November 5-9, 2013 Guanajuato, México

3RD USA-MEXICO WORKSHOP IN BIOLOGICAL CHEMISTRY: PROTEIN FOLDING, DYNAMICS AND FUNCTION CUARTO CONGRESO DE LA RAMA DE FISICOQUÍMICA, ESTRUCTURA Y DISEÑO DE PROTEÍNAS DE LA SOCIEDAD MEXICANA DE BIOQUÍMICA LIST OF SPEAKERS Claudia Benitez IPN Luis Brieba Cinvestav Ismael Bustos UNAM Silvia Cavagnero U. of Wisconsin-Madison Patricia Clark U. of Notre Dame Luis del Pozo INMEGEN Jorge Alegre Cebollada Columbia University Angel E. García Rensselaer Polytechnic Institute Bertrand García-Moreno Johns Hopkins University Lila Gierasch U. of Massachusetts Amherst Michael L. Gross Washington U. St. Louis Jonathan King MIT Rosario Muñoz UNAM Luis Olguín UNAM Rohit V. Pappu Washington U. St. Louis Nina Pastor UAEM Kevin Plaxco UCSB Adela Rodríguez UNAM Alfredo Torres UNAM Jonathan Wall The University of Tennessee Rafael Zubillaga UAM

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Symposium Overview

Tuesday 5

Registration 12:00 – 17:30 hrs

Wednesday 6

Thursday 7

Friday 8

Conference 3 Rosario Muñoz Clares 8:30 – 9:10

Conference 8 Claudia Benítez Cardoso 8:30 – 9:10

2 Oral Presentations Lilian GonzálezSegura César AguirreMartínez 9:10– 9:40

2 Oral Presentations Sagar V. Kathuria Haven A. López Sánchez 9:10– 9:40

Conference 14 Luis Brieba 9:00 – 9:40

Coffee break 9:40 - 9:55

Coffee break 9:40 - 9:55

Coffee break 9:40 – 9:55

Conference 4 Rohit V. Pappu 9:55 – 10:35

Conference 9 Rafael Zubillaga 9:55 – 10:35

3 Oral Presentations Maripaz Márquez Viviana Zomosa Signoret Nancy O. Pulido Mayoral 10:35 – 11:20

3 Oral Presentations Andrea GutiérrezQuezada Sergio RomeroRomero Charles Emglish 10:35 – 11:20

3 Oral Presentations Koga Nobuyasu Anna J. Simon Cristina Dezi 10:35 – 11:20

Coffee break 11:20 – 11:35

Coffee break 11:20 – 11:35

Coffee break 11:20 – 11:35

Conference 5 Nina Pastor 11:35 – 12:15

Conference 10 Bertrand GarcíaMoreno 11:35 – 12:15

Conference 16 Adela Rodríguez 11:35 – 12:15

Conference 6 Luis del Pozo 12:15 – 12:55

Conference 11 Luis Olguin 12:15 – 12:55

Conference 17 Alfredo Torres 12:15 – 12:55

Lunch 13:00 – 15:00

Lunch 13:00 – 15:00

Lunch 13:00 – 15:00

Conference 15 Kevin W Plaxco 9:55 – 10:35

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Welcome Message 17:30 – 17:45 Conference 1 Silvia Cavagnero 17:45 – 18:25 Conference 2 Patricia Clark 18:25 – 19:05 Cocktail de bienvenida 19:05-

Conference 7 Jonathan King 15:00– 15:40

Conference 12 Michael Gross 15:00 – 15:40

Conference 18 Angel García 15:00 – 15:40

3 Oral Presentations Carolina SánchezLópez Roberto Carlos Maya Martínez Gilberto ValdésGarcía 15:40 – 16:25

3 Oral Presentations Leticia Ramírez Silva Mariel Zarco-Zavala Richard N. Besingi 15:40 – 16:25

3 Oral Presentations Daniel-Adriano Silva Gilberto Velázquez Juárez Annia RodriguezHernandez 15:40 – 16:25

Coffee break 16:25 – 16:40

Coffee break 16:25 – 16:40

Coffee break 16:25 – 16:40

Conference 13 Ismael Bustos 16:40 – 17:20

Conference 19 Jonathan Wall 16:40 – 17:20 Conference 20 Jorge Alegre Cebollada 17:20 – 18:00 Conference 21 Lila Gierash 18:00 – 18:40

3 Oral Presentations Laura Dominguez Oksana A. Sergeeva Adriana Espinosa 16:40 – 17:25 Conference Agilent Ginger Cooper 17:25 -17:40

Poster Session 17:30 – 19:30

Closing Remarks Poster Session 17:40 – 19:40

Callejoneada 21:00 -

18:40 - 19:00

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TUESDAY, NOVEMBER 5, 2013 Time

Event

12:00 – 17:30

Registration

17:30 – 17:45

Welcome note

17:45 - 18:25

1

The ribosome at the crossroad between protein folding and aggregation Silvia Cavagnero University of Wisconsin, Madison, USA

Effects of Vectorial Folding on Protein Energy Landscapes 18:25 – 19:05

2

Patricia L. Clark University of Notre Dame, Notre Dame, USA

19:30

Welcome Cocktail

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WEDNESDAY, NOVEMBER 6, 2013 Time

8:30 - 9:10

Event

3

Structural determinants of the aldehyde specificity of plant ALDH10 enzymes: Implications for the synthesis of the osmoprotectant glycine betaine Rosario A. Muñoz Clares Facultad de Química, UNAM, México Oral Contributions:

9:10 – 9:40

Structural and catalytic roles of Glu464 in the betaine aldehyde dehydrogenase from Pseudomonas aeruginosa Lilian González Segura. Facultad de Química, UNAM, México Kinetic and thermodynamic characterization of PaSDSA1 sulfatase César Aguirre Martínez. Facultad de Química, UNAM, México

9:40 – 9:55

9:55 – 10:35

Coffee break

4

Unmasking the roles of N- and C-terminal flanking sequences from exon 1 of the huntingtin protein as modulators of polyglutamine aggregation Rohit V. Pappu Washington University in St. Louis, USA Oral Contributions:

10:35 - 11:20

Amyloid-beta aggregation: Evaluating the effect of a bifunctional peptide and Cu2+ Maripaz Márquez. Departamento de Química, Cinvestav, México Effect of Beta amyloid peptide on Herpes Simplex Virus Type 1 infection (VHS-1) Viviana Zomosa Signoret. Facultad de Medicina, UANL, México Thermodynamic characterization of aminoacid binding to LAO-Binding Protein Nancy O. Pulido Mayoral. Facultad de Medicina, UNAM, México

11:20 – 11:35 11:35 – 12:15

Coffee break

5

What makes an Ig domain amyloidogenic? A tale of two patients Nina Pastor Facultad de Ciencias, UAEMor, México

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WEDNESDAY, NOVEMBER 6, 2013 Time 12:15 – 12:55

Event 6

From primary sequence to conformational changes in light chain amyloidogenesis Luis del Pozo Yauner Instituto Nacional de Medicina Genómica, México

13:00– 15:00

15:00 – 15:40

Lunch time

7

Folding, Unfolding, and Domain Swapping of Human D-crystallin in Relation to Cataract Jonathan King Massachusetts Institute of Technology, USA Oral Contributions:

15:40 - 16:25

Cu(II) binding to islet amyloid polypeptide (IAPP) and its effect on fibrillization Carolina Sánchez López. Departamento de Química, Cinvestav, México Conformational dynamics of amyloidogenic protein 6aJL2 Roberto Carlos Maya Martínez. Laboratorio de Bioquímica y Resonancia Magnética Nuclear, UAEMor, México 6aJL2 and R24G amyloidogenic proteins populate pro-fibril states differently Gilberto Valdés García. Facultad de Ciencias, UAEMor, México

16:25 – 16:40

Coffee break Oral Contributions:

16:40 – 17:25

The effect of sequence dimerization and membrane composition in the structure of APP-C99 Laura Dominguez. Chemistry Department, Boston University, USA Characterization of the substrate recognition and subunit assembly properties of homo-oligomeric human CCT subunits of TRiC Oksana A. Sergeeva. Department of Biology, Massachusetts Institute of Technology, USA Systematic identification of moonlighting proteins in yeast metabolism Adriana Espinosa. Langebio, Cinvestav, México

17:25 – 17:40

Single Crystal X-Ray Diffraction for Protein Crystallography Ginger Cooper. Agilent Technologies

17:40 – 19:40

POSTER SESSION 1

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THURSDAY, NOVEMBER 7, 2013 Time 8:30 - 9:10

Event 8

From protein folding to drug design. Studies on triosephosphate isomerase from Trichomonas vaginalis Claudia G. Benítez Cardoso Escuela Nacional de Medicina y Homeopatía, IPN, México Oral Contributions:

9:10 – 9:40

Off-pathway intermediates and frustration in the microsecond folding reactions of CheY Sagar V. Kathuria. University of Massachusetts Medical School, USA The folding pathway of 6aJL2 Haven A. López Sánchez. Facultad de Medicina, UNAM, México

9:40 – 9:55 9:55 – 10:35

Coffee break

9

Sensing Molecular Interactions through Binding Heat Capacity: Triosephosphate Isomerase Binding Phosphorylated Inhibitors Rafael A. Zubillaga Departamento de Química, UAM-Iztapalapa, México Oral Contributions: The Structural Basis of Protein Kinetic Stability: the Trypanosomatidae's TIMs case Andrea Gutiérrez Quezada. Facultad de Química, UNAM, México

10:35 - 11:20

Kinetic and thermodynamic control in the thermal unfolding of bacterial Triosephosphate Isomerases Sergio Romero Romero. Facultad de Medicina, UNAM, México Effects of Charge Perturbations on the Structural Ensemble of the TC5b Trp-cage Charles A. Emglish. Rensselaer Polytechnic Institute 11:20 – 11:35

Coffee break pH dependent processes in proteins

11:35 – 12:15

10

Bertrand Garcia-Moreno E Department of Biophysics, Johns Hopkins University, USA

12:15 – 12:55

11

Enzyme promiscuity as a tool to characterize enzymatic mechanisms of sulfate and phosphate hydrolysis Luis Olguin Facultad de Química, UNAM, México

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THURSDAY, NOVEMBER 7, 2013 Time

Event

13:00– 15:00

15:00 – 15:40

Lunch time

12

Can Mass Spectrometry Play a Role in Protein Biophysics? Michael L. Gross Departments of Chemistry, Immunology and Medicine, Washington University in St. Louis, USA Oral contributions: Role of allosteric activators in the catalytic expression of two isoforms of pyruvate kinase present in Vibrio cholerae Leticia Ramírez Silva. Facultad de Medicina, UNAM, México

15:40 - 16:25

A novel control mechanism of the F1FO-ATP synthase nanomotor of proteobacteria exerted by the inhibitory ζ subunit Mariel Zarco Zavala. Facultad de Química, UNAM, México An alternative mechanism for efficient outer membrane secretion for an autotransporter protein lacking a C-terminal stable core Richard N. Besingi. Department of Chemistry and Biochemistry, University of Notre Dame, USA 16:25 – 16:40 16:40 – 17:20

Coffee break

13

Parvovirus B19 virus-like particles: surface-presentation of molecules and assembly competence Ismael Bustos Facultad de Medicina, UNAM, México

17:30 – 19:30 21:00

POSTER SESSION 2 CALLEJONEADA

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FRIDAY, NOVEMBER 8, 2013 Time 9:00 - 9:40

Event 14

Evolution drive studies in Nucleic Acid polymerases Luis G. Brieba Langebio, Cinvestav, México

9:40 – 9:55 9:55 – 10:35

Coffee break

15

How I hope to save the world through folding Kevin W. Plaxco University of California in Santa Barbara, USA Oral Contributions: Principles for designing ideal protein structures Koga Nobuyasu. University of Washington, USA

10:35 - 11:20

The rational design of high sensitivity biomolecular receptors via reverse engineering of allosteric cooperativity Anna J. Simon. University of California, Santa Barbara, USA Theoretical systematic study of polyglutamine chains (from 7 until 45 units): influence of environment and temperature on conformational dynamics Cristina Dezi. Departamento de Química, Cinvestav, México 11:20 – 11:35

11:35 – 12:15

Coffee break

16

Structural and functional insights into plant defense proteins considered as cross-reacting allergens. Adela Rodríguez Romero Instituto de Química, UNAM, México

12:15 – 12:55

17

Bacterial glycyl tRNA synthetase and Ribonuclease P: the before and after of a crystal structure Alfredo Torres Larios Instituto de Fisiología Celular, UNAM, México

13:00– 15:00

15:00 – 15:40

Lunch time

18

Simulations of the folding unfolding of proteins under different solvent and confinement condition Angel E. Garcia Rensselaer Polytechnic Institute, New York, USA

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FRIDAY, NOVEMBER 8, 2013 Time

Event Oral Contributions: Millisecond Dynamics of RNA Polymerase II Translocation Daniel Adriano Silva. Department of Chemistry, The Hong Kong University of Science and Technology, Hong Kong

15:40 - 16:25

Conservation of promoter melting mechanisms in divergent regions of the single-subunit RNA polymerases Gilberto Velázquez Juárez. Langebio, Cinvestav, México Structural and Mechanistic Basis for Enhanced Translational Efficiency by 2Thiouridine at the tRNA Anticodon Wobble Position Annia Rodriguez Hernandez. University of California at Santa Barbara, USA 16:25 – 16:40 16:40 – 17:20

Coffee break

19

Design and characterization of amyloid-reactive peptides using small animal molecular imaging and correlative studies Jonathan Wall The University of Tennessee, USA

17:20 – 18:00

20

Physiology of protein folding and unfolding under force Jorge Alegre Cebollada Columbia University, New York, USA

18:00 – 18:40

21

Exploring the Relationship between the Folding Properties of a Protein and Its Dependence on the Proteostasis Network Lila M. Gierasch Departments of Biochemistry and Molecular Biology and Chemistry, University of Massachusetts, USA

18:40 – 19:00

CLOSSING REMARKS

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POSTER SESSION 1. WEDNESDAY, NOVEMBER 6, 2013 Poster Number

Title/Authors

1A

A protein from Trypanosoma cruzi similar to proteins with RNase P activity Sergio Aguirre-Sampieri, Adelaida Diaz-Vilchis, Alfredo Torres-Larios. Instituto de Fisiología Celular.

2A

Thermodynamic study of the weak interactions between proteins and nonspecific ligands Oscar Arroyos Rosales, Miguel Costas. Laboratorio de Biofisicoquímica, Departamento de Fisicoquímica, Facultad de Química, UNAM.

3A

The thermal characterization of monoTcTIM Reyna Miriam Bastida Santoyo1, Misrain Gurrola1, María Elena Chánez Cárdenas2 and Edgar Vázquez Contreras1. 1 Departamento de Ciencias Naturales, Universidad Autónoma Metropolitana Unidad Cuajimalpa. 2 Laboratorio de Patología Vascular Cerebral, Instituto Nacional de Neurología y Neurocirugía “Manuel Velasco Suárez”.

4A

Alda-1 protects ALDH2 against inactivation by lipid aldehydes Javier Belmont*1 and José S. Rodríguez-Zavala1. 1Departamento de Bioquímica, Instituto Nacional de Cardiología.

5A

A combined integrative genomics and protein structure-function approach to inferring biologically relevant genes in cancer Shirley Bikel, Karla Backhoff, Xavier Soberón and Adrián Ochoa-Leyva. INMEGEN.

6A

Design and characterization of consensus Rossmann domain Iris Bravo B1, Lorenzo Segovia1. 1Departamento de Ingeniería Celular y Biocatálisis, Instituto de Biotecnología, UNAM.

7A

Effects of carboxy-terminal mutations on the oligomerization and activity of the nitrilase from R. pyridinovorans Alejandro E. Cáliz Rodríguez, Julio C. Quintana Rojas, Georgina Garza-Ramos. Lab. Fisicoquímica e Ingeniería de Proteínas. Departamento de Bioquímica, Facultad de Medicina, Universidad Nacional Autónoma de México.

8A

Crystallographic and biochemical studies evidencing the dimeric formation in solution of thioredoxin 1 from white leg shrimp Litopenaeus vannamei Adam A. Campos-Acevedo and Emrique Rudiño-Piñera. Departamento de Medicina Molecular y Bioprocesos. Instituto de Biotecnología, UNAM.

9A

Structural determinants of amyloid fibril formation in Triosephosphate isomerase M. en C. Edson Norberto Cárcamo Noriega, Dra. Gloria Saab Rincón. Instituto de Biotecnología de la Universidad Nacional Autónoma de México

10A

Influence of cavities on the stability and pressure sensitivity of proteins José A. Caro1, Mariano Dellarole2, Jamie L. Schlessman1, Catherine A. Royer2, Bertrand GarcíaMoreno E1*.1Department of Biophysics, Johns Hopkins University, 2Centre de Biochimie Structurale, CNRS.

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11A

Homology modeling and molecular dynamics of Helicobacter pylori enolase Normandé Carrillo Ibarra1,2, Dr. César Augusto S. López Rayes1, Dr. José Correa-Basurto2 y Claudia Benítez-Cardoza1. 1Escuela Nacional de Medicina y Homeopatía, 2Laboratorio de Modelado Molecular y Bioinformática de la Escuela Superior de Medicina, Instituto Politécnico Nacional.

12A

Docking studies of peptides anti-HSV derived of the fusion glycoproteins gB and gH of HSV-1 and HSV-2 Cetina Abraham, López Uriel, Barrón Blanca. Laboratorio de Virología, Departamento de Microbiología, Escuela Nacional de Ciencias Biológicas (ENCB), IPN.

13A

A method for the identification of residues responsible for switching protein specificity based on fold space neighboring structures R. Corral Corral, Gabriel del Rio. Department of Biochemistry and Structural Biology, Instituto de Fisiología Celular, Universidad Nacional Autónoma de México.

14A

Comparative analysis of gp21 gene of the brucellaphages BFM1, Iz, Bk, Pr and Tb. Cuatepotzo-Burgos Francisco Manuel1; Flores-López Victor Missael2; López-Merino Ahidé1.1Laboratorio de Microbiología Especializada, Dpto. Microbiología, ENCB. IPN. 2 Departamento de genética y biología molecular, CINVESTAV.

15A

Why is the hypertermophilic pyruvate kinase from Thermofilum pendens K+independent? Gustavo De la Vega-Ruiz1, AlfredoTorres-Larios2, Leticia Ramírez Silva1*.Departamento de Bíoquimica. Facultad de Medicina1, Instituto de Fisiología Celular2, UNAM.

16A

The binding of lactose and biological ligands to β-lactoglobulin at the calyx and the dimer interface: a theoretical study Lenin Domínguez-Ramírez 1*, Elizabeth Del Moral-Ramírez 2, Paulina Cortes-Hernández 1, Mariano García-Garibay 3, Judith Jiménez-Guzmán 3,* 1Departamento de Ciencias de la Salud, Universidad Autónoma Metropolitana-Lerma. 2Departamento de Ciencias de la Alimentación, Universidad Autónoma Metropolitana-Lerma. 3Departamento de Biotecnología, Universidad Autónoma Metropolitana, Iztapalapa.

17A

Constructing a methylmalonyl Co-A mutase and MMA oligomer using crystallographic data, bioinformatics and the human mutation database Fernández-Lainez C1,2, Takahashi-Iñiguez T2, Vela-Amieva M1, Flores ME2, Domínguez L3. 1 Instituto Nacional de Pediatría. 2Instituto de Investigaciones Biomédicas. 3Universidad Autónoma Metropolitana.

18A

Location and sequencing of the gene encoding the expression of Bacillus sp amidases. degrade charged acrylamide Ricardo Flores Romero, María del Carmen Oliver‐Salvador, Marina Olivia Franco‐Hernández. Unidad Profesional Interdisciplinaria de Biotecnología.

19A

Development of FRET approaches to study protein folding on the ribosome Andrew M. Fuchs, Teddy S. Jennaro and Silvia Cavagnero. University of Wisconsin, Madison.

20A

Deciphering the ligand-binding energetic strategies of the lipocalin -lactoglobulin Gabriel Gutiérrez-Magdaleno, Martiniano Bello, Alfonso Labra-Núñez and Enrique GarcíaHernández. Departamento de Química de Biomacromoléculas, Instituto de Química, UNAM.

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21A

Biochemical Studies of Arginine Kinase from white shrimp Litopenaeus vannamei Karina D. Garcia-Orozco, José Max Hernandez-Flores, Rogerio R. Sotelo-Mundo. Laboratorio de Bioquímica de Proteínas Recombinantes. Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo, A.C. (CIAD).

22A

Omeprazole and its derivatives as new candidates to inactivate triosephosphate isomerase from Giardia lamblia Itzhel García-Torres, Sergio Enríquez-Flores, Adriana Castillo-Villanueva, Saúl Gómez-Manzo, Sara Teresa Méndez, Ignacio De la Mora de la Mora, Jaime Marcial Quino, Angélica TorresArroyo, Jesús Oria-Hernández, Gabriel López-Velázquez, Gabriel Navarrete-Vázquez and Horacio Reyes-Vivas. Laboratorio de Bioquímica-Genética, Instituto Nacional de Pediatría.

23A

Role of allosteric activators in the catalytic expression of two isoforms of pyruvate kinase present in Vibrio cholerae 1 Carlos Guerrero-Mendiola, 2Alfredo Torres-Larios and 1*Leticia Ramírez-Silva. 1Departamento de Bioquímica, Facultad de Medicina, UNAM, 2IFC, UNAM.

24A

Structural and functional characterization of three pathologic variants causing Glucose-6phosphate dehydrogenase deficiency in humans Saúl Gómez-Manzo Ignacio De la Mora-De la Mora, Sergio Enríquez-Flores, Itzhel GarcíaTorres, Jaime Marcial-Quino, Sara Teresa Méndez, Adriana Castillo-Villanueva, Jessica TerrónHernández, Sandra Tobón-Cornejo, Angélica Torres-Arroyo, América Vanoye-Carlo, Gabriel López-Velázquez, Horacio Reyes-Vivas, Jesús Oria-Hernández. Laboratorio de Bioquímica Genética, Instituto Nacional de Pediatría.

25A

Conformational dynamics of the protein triosephosphate isomerase: a simulation study Norma Elizabeth González Díaz1, Ponciano García-Gutiérrez2, Jorge López-Lemus1, Roberto López-Rendón1. 1Facultad de Ciencias, Universidad Autónoma del Estado de México. 2Depto. de Química, Universidad Autónoma Metropolitana-Iztapalapa.

26A

Biochemical characterization of thymidine monophosphate kinase from white spot syndrome virus: a functional domain from the viral ORF454 Eduardo Guevara-Hernandez 1, Luis G. Brieba2, Karina D. Garcia-Orozco 1, Rogerio R. SoteloMundo 1.1 Laboratorio de Bioquímica de Proteínas Recombinantes. Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo, A.C. (CIAD). 2 Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad (LANGEBIO), Centro de Investigación y Estudios Avanzados-Unidad Irapuato.

27A

Improved thermostability of triosephosphate isomerase by rational proline substitutions Valeria Guzmán1, Andrea Gutiérrez2, Nallely Cabrera1, Jessica Díaz2, Ruy Pérez-Montfort1, Miguel Costas2. 1Instituto de Fisiología Celular, UNAM. 2Facultad de Química, UNAM.

28A

How catalase recognizes H2O2 in a sea of water Laura Domínguez1, Alejandro Sosa-Peinado1, Wilhelm Hansberg2. 1Departamento de Bioquímica, Facultad de Medicina, UNAM. 2Departamento de Biología Celular y Desarrollo, Instituto de Fisiología Celular, UNAM.

29A

Optimizing peroxidase and nanoparticle immobilization for enhanced enzymatic functionality Iker Iñarritu1, Eduardo Torres2, José Campos-Terán1. 1 Departamento de Procesos y Tecnología, DCNI, Universidad Autónoma Metropolitana Unidad Cuajimalpa. 2 Benemérita Universidad Autónoma de Puebla.

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30A

Voltage gating and electromechanical coupling in the Kv1.2 potassium channel Itzel G. Ishida, Gisela E. Rangel-Yescas, León D. Islas. Departamento de Fisiología, Facultad de Medicina, UNAM.

31A

Protein engineering with immunoglobulin-like fold Pedro Jimenez-Sandoval, Luis G. Brieba. Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad, Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del Instituto Politécnico Nacional.

32A

The effect of the neutral drift on the evolution of substrate specificity and protein stability Ana Juárez-Vázquez and Francisco Barona-Gómez. Evolution of Metabolic Diversity Laboratory. LANGEBIO.

33A

Theoretical and spectroscopic study of Cu(I) binding to the fragment 106-115 of the human prion protein Arcos Trinidad1, Qayyum Munzarin2, Rivillas-Acevedo Lina1, Miotto Marco3, Grande-Aztatzi Rafael1, Fernandez Claudio O.3, Vela Alberto1, Solomon Edward I.2, Quintanar Liliana1,* 1 Departamento de Química, Cinvestav. 2Department of Chemistry, Stanford Universit. 3IBR, Universidad Nacional de Rosario.

34A

Spectroscopic study of wheat germ agglutinin denaturalization by guanidine hydrochloride Itzel López-González, Enrique García-Hernández , Patricia Cano-Sánchez, Eduardo LeyvaHernández. Departamento de Química de Biomacromoléculas, Instituto de Química, UNAM.

35A

Biochemical characterization of Helicobacter pylori recombinant enolase María de J. López- Lopez1, Claudia G. Benítez-Cardoza2, Xianwu Guo1. 1Centro de Biotecnología Genómica, IPN. 2Escuela Nacional de Medicina y Homeopatía, IPN.

36A

Adsorption kinetics of triosephosphate isomerase to the air/water interface using dynamic surface tension Adriana Lozoya Colinas, Miguel Costas. Laboratorio de Biofisicoquímica, Departamento de Fisicoquímica, Facultad de Química, UNAM.

37A

Structural modeling of peptides with anticancer activity and assays of their effects in the cell line mcf-7 of breast cancer Carlos Francisco Madrazo Moya1, Ezra Michelet Garcia Romero1,Nidia Briseyda Domínguez Jiménez, Carolina Barrientos-Salcedo1,2, Catalina Soriano-Correa3. 1Laboratorio de Investigacion en Química Médica, Facultad de Bioanálisis Región Veracruz, Universidad Veracruzana. 2 Escuela de Medicina Campus Calasanz, UCC.

38A

An exotic mechanism of allosteric regulation: The GlcN6P deaminase of S. oneidensis (NagBII) Jorge Marcos-Viquez, Laura Alvarez-Añorve y Mario L. Calcagno. LFQIP, Depto. de Bioquímica, Facultad de Medicina, UNAM.

39A

Theoretical studies and pharmacological characterization of a new antagonist "C9" of vasopressin receptors Marlet Martinez-Archundia 1,2, Gilles Guillon2 and Jose Correa Basurto 1. 1 Molecular Modeling and Drug Design Laboratory, IPN. 2 Institut de Genomique Fonctionelle.

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40A

Energetic basis of multidomain structural organization of the WGA: study of the isolated domains Jorge L. Medrano-Cerano, Patricia Cano Sánchez, Enrique García Hernández. Departamento de Química de Biomacromoléculas, Instituto de Química, UNAM.

41A

Hereditary amyloidosis and their correlation with structural changes in the molten globule of lipid free-ApoAI Paola Mendoza-Espinosa, Enrique García Hernández. Instituto de Química, Universidad Nacional Autónoma de México.

42A

Structure-Activity relationship of the expansin-like protein PcEXP of the plant pathogen Pectobacterium carotovorum Mendoza-Nuñez Mario1, Olarte-Lozano Miguel2,Segovia Lorenzo1 and Martinez-Anaya Claudia1. 1 Instituto de Biotecnología, UNAM. 2Centro de Investigación en Biotecnología, UAEM.

43A

Design, synthesis and in silico evaluation of compounds as inhibitors of H1N1 hemagglutinin and neuraminidase Elaheh Mirzaeicheshmeh , 1Dr Babak Khalili Haddad and 2Dr.Federico Martinez 3José Correa Basurto. Laboratorio de Modelado Molecular y Bioinformática de la Escuela Superior de Medicina, Instituto Politécnico Nacional, Escuela Nacional de Ciencias Biológicas and Islamic Azad University of Roudehen.

44A

Theoretical study of molecular evolution of a duplicate thioredoxin peroxidase in Saccharomyces cerevisiae Muñoz González, Z. M. y Delaye Arredondo, L. J.vCINVESTAV Unidad Irapuato.

45A

Assessing non covalent interactions in the crystal of the GNNQQNY peptide Jorge Nochebuena y Joel Ireta. Departamento de Química. UAM-I.

46A

Catalytic promiscuity in the metallo-β-lactamase superfamily: the case of tRNase Z José Eduardo Olea Hernández, Luis Olguín. Laboratorio de Biofisicoquímica, Facultad de Química, UNAM.

47A

Functional characterization of EhCFIm25 from Entamoeba histolytica: identification of amino acid residues involved in RNA binding Juan David Ospina-Villa1, Absalom Zamorano-Carrillo1,2, María Esther Ramírez-Moreno1,2, César López-Camarillo3, and Laurence A. Marchat1,2. 1Posgrado en Biomedicina Molecular, 2Doctorado en Biotecnología en Red, ENMH-IPN. 3Posgrado en Ciencias Genómicas, Universidad Autónoma de la Ciudad de México (UACM).

48A

Characterization of polyphenol oxidase from mango (Mangifera indica cv. Manila) Gisela Palma-Orozcoa,b, Hugo Nájerab. a Unidad Profesional Interdisciplinaria de Biotecnología – IPN, Departamento de Bioprocesos. b Universidad Autónoma Metropolitana – Cuajimalpa, Departamento de Ciencias Naturales.

49A

Search for 6a-R25G inhibitors for the amyloid fibril formation process Ángel E. Peláez Aguilar, Roberto Carlos Maya Martínez, Carlos Amero Tello, Laboratorio de Bioquímica y Resonancia Magnética Nuclear, Centro de Investigaciones Químicas, UAEM.

50A

NAL aldolase family: History and evolutionary diversification of a chemical reaction and a protein fold – Searching for ancestral promiscuity Bernardo Pérez-Zamorano1, Arturo Carlos II Becerra-Bracho1, Fernanda Artemisa EspinozaHernández1, Alejandro Sosa-Peinado2. 1Depto. de Biología Evolutiva, UNAM. 2LFQIP UNAM.

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51A

Thermodynamic study of Triosephosphate isomerases from Trichomonas vaginalis: comparisons of the stability between dimeric mutants of residue 45 in WT1 and WT2 María del Carmen Portillo-Téllez1, Priscila Estrella Hernández, Claudia G. Benítez-Cardoza2, Luis G. Brieba de Castro1. Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad, Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del IPN1. Laboratorio de Investigación Bioquímica, Programa Institucional en Biomedicina Molecular ENMyH-IPN2.

52A

Molecular modeling studies evidence mutations that alter the ligand recognition by neuraminidase from influenza A H1N1 Ramírez-Salinas Gema L1, Quiliano Miguel, Mirko Zimic2, Verónica Briz3, Correa-Basurto J1 . 1 Laboratorio de Modelado Molecular y Bioinformática, Sección de Estudios de Posgrado e Investigación, Escuela Superior de Medicina, Instituto Politécnico Nacional.

53A

Modeling of the early stages of protein-ligand interactions using differential evolution Laura Reyes-Ortega1, Astrid E. Viveros-Pedraza1, José Correa-Basurto2, Absalom ZamoranoCarrillo3, Claudia Benítez-Cardoza3, Miriam Pescador-Rojas4, Rosaura Palma-Orozco1, Jorge L. Rosas-Trigueros1. 1Laboratorio Transdisciplinario de Investigación en Sistemas Evolutivos SEPIESCOM-IPN. 2Escuela Superior de Medicina, IPN. 3Escuela Nacional de Medicina y Homeopatía, IPN. 4Departamento de Ciencias de la Computación.

54A

Molecular Dynamics simulations of GIPR protein embedded in a lipid bilayer membrane Angel Rivera-Delgado1, Jonatan H. Sánchez-Álvarez1, Irene Mendoza-Lujambio3, Jesús I. Murillo-Álvarez4, Eleazar Lara-Padilla3, Miriam Pescador-Rojas2, Jorge L. Rosas-Trigueros1, Rosaura Palma-Orozco1. 1Laboratorio Transdisciplinario de Investigaciones en Sistemas Evolutivos, SEPI-ESCOM-IPN. 2Departamento de Ciencias de la Computación, IPN. 3Escuela Superior de Medicina, IPN. 4Centro Interdisciplinario de Ciencias Marinas, IPN.

55A

Structure-function relationship of recombinant vasoinhibins Robles, JP, Cruces-Solís, H, Jeziorski, MC, Martínez de la Escalera, G, Moreno-Carranza, B, Clapp, C. Instituto de Neurobiología, UNAM.

56A

Activation of Human Aldehyde Dehydrogenase 1A1 by Tamoxifen José S. Rodríguez-Zavala. Departamento de Bioquímica, Instituto Nacional de Cardiología.

57A

Aβ monomers transiently sample oligomer and fibril-like configurations: ensemble characterization using a combined MD/NMR approach David J. Rosenman1, Christopher Connors2, Wen Chen1, Chunyu Wang1,2, Angel E. García1,3. 1 Department of Biology. 2Graduate Program in Biochemistry and Biophysics. 3Department of Physics, Applied Physics and Astronomy. 1-3Rensselaer Polytechnic Institute.

58A

Catalytic promiscuity in Choline-O-sulfatase from Sinorhizobium meliloti Juan José Sánchez Romero, Luis Olguín. Laboratorio de Biofisicoquímica, Facultad de Química, UNAM.

59A

The two subdomains of the DNA-binding domain of TBP display different responses to increasing temperature José Ángel Santiago-Terrones, César Millán-Pacheco, Nina Pastor. Facultad de Ciencias, UAEMor.

60A

Structural and kinetic studies of choline monooxygenase from Spinacia oleracea Hugo Serrano-Posada1, Sara Centeno-Leija2, Enrique Rudiño-Piñera2, Rosario A. MuñozClares1. 1Facultad de Química, UNAM. 2Instituto de Biotecnología, UNAM.

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61A

Redesign of ligand binding interaction constrained by protein evolution and conformational dynamics Alejandro Sosa Peinado, Jesús Agustín Banda Vázquez, Karina Marisol Maya Ramírez, Andrés Escandón Flores, Tania Raquel Berrocal Gama. Bernardo Pérez Zamorano. LFQIP, Depto. Bioquímica, Facultad de Medicina (UNAM).

62A

Biochemical characterization of an active chimeric Shikimate dehydrogenase Gustavo Tapia-Urzúa, Lorenzo Segovia. Instituto de Biotecnología, UNAM.

63A

Structural analysis of plant Tau-class Glutathione S-Transferase (GSTU) involved in anthocyanin transport Ignacio Valenzuela-Chavira1, Carmen A. Contreras-Vergara1, Karina García-Orozco2, Aldo A. Arvizu-Flores3 and María A. Islas-Osuna1. 1Genética y Biología Molecular de Plantas, 2 Laboratorio de Bioquímica de Proteínas Recombinantes; Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo, A. C. 3Ciencias Químico-Biológicas, Universidad de Sonora.

64A

The folding mechanism of the lysine, arginine, ornitine binding protein (LAO) Jesús Renan Vergara Gutiérrez1, Haven A. López Sánchez1, Alejandro Sosa Peinado1, D. Alejandro Fernández Velasco1. Facultad de Medicina1. Universidad Nacional Autónoma de México.

65A

Rational search for a compound that selectively inhibits the triose phosphate isomerase from Trichomonas vaginalis Vique Sanchez JL 1, Benitez Cardoza C1, Brieba Luis2 Priscilla Estrella2 Rossana Arroyo3, Jaime Ortega3, Arturo Rojo4, Ponciano Garcia4. 1ENMH-IPN, 2LANGEBIO, 3CINVESTAV, 4UAMIztapalapa.

66A

Analysis of the susceptibility of the binding site of NAD+ of ALDH3 by lipoperoxidation products Yoval-Sánchez Belem and Rodríguez-Zavala José S. Departamento de Bioquímica, Instituto Nacional de Cardiología “Ignacio Chávez”.

67A

Intrinsically disordered regions as factors involved in protein-protein interactions in interactomes. Alejandra Zavala-Castillo y León-Patricio Martínez-Castilla. Laboratorio de Bioinformática, Departamento de Bioquímica, Facultad de Química. UNAM.

68A

Biophysical characterization of the 6 amyloidogenic protein AR. Luis del Pozo-Yauner1, Martín González-Andrade1, Baltazar Becerril-Luján2, Rosana SánchezLópez2, Héctor Ceceña-Álvarez3, Julio I. Pérez-Carrión1, Ernesto Ortiz-Surí2, D. Alejandro Fernández-Velasco 3. 1Instituto Nacional de Medicina Genómica. 2Instituto de Biotecnología, UNAM. 3Facultad de Medicina, UNAM.

69A

The functional incorporation of Tyr-coumarin into proteins synthesized by HEK293T cells Ximena Steinberg1, Jason Galpin2, Samuel Goodchild3, Christopher.Ahern2 and Sebastián Brauchi1,3. Universidad Austral de Chile1. University of Iowa2 and University of British Columbia3.

70A

Influence of trapped interfacial water on the binding thermodynamics of phosphorylated inhibitors to triosephosphate isomerase Serratos Iris N. 1, Gerardo Pérez-Hernández 2 , Garza-Ramos G. 3, Millán-Pacheco C.4 and Rafael A. Zubillaga1. 1Depto. de Química, UAM-Iztapalapa. 2Depto. de Ciencias Naturales, UAM– Cuajimalpa. 3Depto. de Bioquímica, Facultad de Medicina, UNAM. 4Departamento de BioquímicaBiología Molecular, Facultad de Ciencias, UAEMor.

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71A

Interaction beetwen the soluble receptor for advanced-glycation-endproducts (sRAGE) and neurotoxins Iris N. Serratos1, Dulce Galicia1, Nina Pastor2, César Millán-Pacheco2, Nallely Cabrera3, Ruy Pérez Montfort3, Ponciano García1, Abel Santamaría4, Francisco Reyes1 and Rafael A. Zubillaga1.1Depto. de Química, UAM-Iztapalapa. 2Facultad de Ciencias UAEMor. 3Instituto de Fisiología Celular, UNAM. 4Instituto Nacional de Neurología y Neurocirugía.

72A

Towards a primordial TATA binding protein Juan Antonio Arias-del Angel1, César Millán-Pacheco2, Nina Pastor2. 1Licenciatura en Ciencias Genómicas, Instituto de Biotecnología, UNAM. 2Facultad de Ciencias, UAEMor.

73A

Biosynthesis expression and characterization of three mutants of defensin 1 Federico del Río-Portilla, Laura Andrea Rodríguez-Solano, Fátima Carolina Escobedo-González, David Flores-Solís, Patricia Cano-Sánchez. Instituto de Química, Universidad Nacional Autónoma de México.

74A

Structural and functional characterization of Indian tarantula venom Poecilotheria regalis Luis Fernando Díaz-Peña, Alejandro García-Arredondo, Alejandra Rojas-Molina. Departamento de Investigación Química y Farmacológica de Productos Naturales, Universidad Autónoma de Querétaro.

75A

Specific activity increase of a beta-propeller phytase Juan Antonio Gallegos-López, José Eduardo Almeyda-Carbajal, Miguel Castillo-Galván, Martha Guerrero-Olazarán, José María Viader-Salvadó. Universidad Autónoma de Nuevo León, Facultad de Ciencias Biológicas, Instituto de Biotecnología.

76A

The minimalist landscapes of proteins and amino acids Enrique Lemus Fuentes. Universidad Tecnológica de la Mixteca.

77A

Identification and characterization of proteins with protease and lipase activities in jackfruit latex Mónica Elizabeth Martínez González. Yolotzin Apatzingán Palomino Hermosillo. Ma. Teresa Sumaya Martínez. Rosendo Balois Morales. Edgar Iván Jiménez Ruiz. Leticia Mónica Sánchez Herrera. Universidad Autónoma de Nayarit. Unidad de Tecnología de Alimentos.

78A

Mapping folding pathway of Ig-like domains: Folding studies of ICPs domains suggest that they fold by conserved folding/unfolding mechanisms Itzel Rentería González1, L.G Brieba de Castro1, Claudia Benítez Cardoza2. 1Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad, Cinvestav. 2 Escuela Nacional de Medicina y Homeopatía del I.P.N.

79A

Comparing the sequence of the oncoproteins 2OQS and 2FK4, determine their possible connection in the human papilloma virus Ronquillo Téllez A. Lazcano Hernández M., Melgoza Palma N. Ivon Pérez Xochipa. Facultad de Ciencias Químicas, BUAP.

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POSTER SESSION 2. THURSDAY, NOVEMBER 7, 2013 Poster Number

Title/Authors

1B

Identification of novel chemical antagonists for two differential markers of cancer stem cells by virtual screening Charmina Aguirre-Alvarado1, Carlos A. García-Pérez2, Aldo Segura-Cabrera3, Marco A. VelascoVelázquez1. 1Departamento de Farmacología Facultad de Medicina UNAM. 2Centro de Biotecnología Genómica IPN. 3Cincinnati Children's Hospital Medical Center, USA.

2B

Characterization of Triosephosphate isomerase dimerization mutants of Trichomonas vaginalis (TvTIM) by Prephenate dehydrogenase activity as reporter Emma L. Arévalo-Salina1, Joel Osuna2, Luis G. Brieba3. 1Escuela de Ciencias, UABJO. 2 Departamento de Ingeniería Celular y Biocatálisis, Instituto de Biotecnología, UNAM. 3 Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad, Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del IPN.

3B

The improvement of the alcoholytic activity of the alpha-amylase AmyA of Thermotoga maritima. Tailoring enzyme selectitivity through thermodynamics Rodrigo A. Arreola-Barroso, Humberto Flores-Soto, Gloria Saab-Rincón. Departamento de Ingeniería Celular y Biocatálisis, Instituto de Biotecnología, UNAM.

4B

Crystal structure of cis-dimer of human CRTAM/CD355 1 Barragan-Galvez J., 2Ortiz-Navarrete V., 1Brieba-Castro L.1LANGEBIO, CINVESTAV.2Departamento de Biomedicina Molecular, Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del Instituto Politéctico Nacional.

5B

Characterization of the Triosephosphate isomerase from Zea Mays Luis Arturo Becerril Sesín, Mariana Schulte-Sasse, Fátima Pardo Ávila, Sergio Romero Romero, D. Alejandro Fernández Velasco. Departamento de Bioquímica, Facultad de Medicina, Universidad Nacional Autónoma de México.

6B

Molecular interactions between bio-active molecules and T-type calcium channels Nidia Beltrán1 Osbaldo López-Charcas2, Teresa Hernández-Segura1, Jacaranda RosendoPineda1, Jerome Verleyen3, Alejandro Sánchez3, Juan Carlos Gómora2 & Manuel Rivera1 1 Laboratorio de Tecnología de Proteínas de Membrana, Facultad de Medicina-Universidad Autónoma del Estado de Morelos. 2Departamento de Neuropatología Molecular, División de Neurociencias, Instituto de Fisiología Celular-Universidad Nacional Autónoma de México. 3 Unidad Universitaria de Apoyo Bioinformático, Instituto de Biotecnología-Universidad Nacional Autónoma de México. Kinetic control in protein folding for light chain amyloidosis and the differential effects of somatic mutations Luis. M. Blancas-Mejía1, Alexander Tischer1,2, James R. Thompson3, Jonathan Tai4, Lin Wang1, Matthew Auton1,2, Marina Ramirez-Alvarado1. 1Department of Biochemistry and Molecular Biology, 2Division of Hematology, 3Department of Physiology and Biomedical Engineering, Mayo Clinic, 200 First St. SW, Rochester, MN 55905. 4Department of Chemistry, University of Illinois.

7B

8B

Biosynthesis, expression and purification of the spider venom recombinant toxin Magi 6 Andrea Cabrera-Peralta, David Flores-Solís, Patricia Cano-Sánchez, José Federico del RíoPortilla. Departamento de Bioquímica, Instituto de Química, UNAM.

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9B

Identification of the residues involved in the inactivation of human aldehyde dehydrogenases by lipid peroxidation products Luis Francisco Calleja, Belem Yoval-Sánchez, José Salud Rodríguez-Zavala. Departamento de Bioquímica, Instituto Nacional de Cardiología (Ignacio Chávez).

10B

QCM adsorption study of peroxidases increased functionality when adsorbed at nanoparticles surfaces Iker Iñarritu1, Eduardo Torres2, José Campos-Terán1. 1Departamento de Procesos y Tecnología, DCNI, Universidad Autónoma Metropolitana-Cuajimalpa. 2Centro de Química-ICUAP, Benemérita Universidad Autónoma de Puebla (BUAP).

11B

Structural analysis of anti-apoptotic proteins of the Bcl-2 family Luis A. Caro-Gómez1, Ian Illizaliturri-Flores1, Jorge Luis Rosas-Trigueros2, José Correa-Basurto3, Claudia G. Benítez-Cardoza1, and Absalom Zamorano-Carrillo1. Laboratorio de Investigación Bioquímica, 1Escuela Nacional de Medicina y Homeopatía, 2Escuela Superior de Computo y 3 Escuela Superior de Medicina. Instituto Politécnico Nacional.

12B

Crystal structure of the crustacean proliferating cell nuclear antigen: structural complementarity with WSSV DNA polymerase Jesus S. Carrasco-Miranda1, Rogerio R. Sotelo-Mundo1, Alonso A. Lopez-Zavala1, Luis G. Brieba 2 , Enrique Rudiño-Piñera 3. Laboratorio de Bioquímica de Proteínas Recombinantes, Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo, A.C. 2Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad. 3Departamento de Medicina Molecular y Bioprocesos, Instituto de Biotecnología UNAM.

13B

Identification of bioactive peptides from germinated soybean protein with anticancer activity Xareni Centeno-Espidio, Marcela González-Montoya, María del Carmen Robles-Ramírez, Rosalva Mora-Escobedo. Escuela Nacional de Ciencias Biológicas, Instituto Politécnico Nacional.

14B

Stability and folding of human leptin Chimal Vega B.,* Padilla Zúñiga J. ~ Marchat Marchau L.* Zamorano Carrillo A.* Reyes López C. A. * Paniagua Castro N- y Benítez-Cardoza C.G.* Laboratorio de Investigación Bioquímica, ENMyH-IPN ~ Laboratorio de Biofiscoquímica, Universidad Autónoma Metropolitana-Iztapalapa, Laboratorio de Farmacología del Desarrollo ENCB-IPN.

15B

Identification of folding subunits in TIM barrels by random circular permutation Yazmín Damián-Almazo, Filiberto Sánchez-López, Paul Gaytan-Colin, Gloria Saab-Rincón. Departamento de Ingeniería Celular y Biocatálisis, Instituto de Biotecnología, UNAM.

16B

Deciphering the role of the N-terminal segment of the light chain in the mechanism of fibrillogenesis Luis del Pozo-Yauner1, Martín González-Andrade1, Héctor Ceceña-Álvarez2, Baltazar BecerrilLuján3, Julio I. Pérez-Carrión1, Rosana Sánchez-López3, Leopoldo Güereca3, D. Alejandro Fernández-Velasco2. 1Instituto Nacional de Medicina Genómica. 2Facultad de Medicina, UNAM. 3 Instituto de Biotecnología, UNAM.

17B

RNA DEAD-box helicases from Bacillus subtilis: functional and structural characterization Díaz-Jiménez Diana Fabiola1, López-Ramírez Varinia2, Olmedo-Álvarez Gabriela1 and Briebade Castro Luis Gabriel3. 1Cinvestav Unidad Irapuato. 2Escuela Nacional de Medicina y Homeopatía IPN. 3Langebio.

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18B

Non-catalytic glycogen-binding site and its functional role in glycogen synthase Adelaida Díaz1, Carlos Martínez-Pons1, Ignacio Fita2, Juan C. Ferrer3, Joan J. Guinovart1, 1 Departament of Molecular Medicine, Institute for Research in Biomedicine. 2The Molecular Biology Institute, CSIC. 3Universitat de Barcelona.

19B

Study of Triosephosphate isomerases from Trichomonas vaginalis (TvTIMs): The role of inter-subunit interactions in enzyme function and stability Priscila Estrella-Hernández1, Samuel Lara2, María del Carmen Portillo-Téllez3, Armando Gómez Puyou4, Claudia Benítez3, Rossana Arroyo5, Jaime Ortega6, Luis G. Brieba1. 1LANGEBIO, CINVESTAV-Irapuato. 2División de Biología Molecular, IPICYT. 3Laboratorio de Investigación Bioquímica, ENMyH-IPN. 4Instituto de Fisiología Celular, UNAM. 5Departamento de Infectómica y Patogénesis Molecular, CINVESTAV-Zacatenco. 6Departamento de Biotecnología y Bioingeniería, CINVESTAV-Zacatenco.

20B

Expression and in vitro folding of two cysteine rich neurotoxins from the venoms of spider and coral snake Vianey Flores-Lara, Herlinda Clement, Gerardo Corzo. Instituto de Biotecnología, UNAM.

21B

Overexpression and characterization of a type m thioredoxin from mango plastids Leonardo Y. Fox-Uribe 1, Mitzuko Dautt-Castro 1, Carmen A. Contreras-Vergara 1, Karina D. García-Orozco 2, Emmanuel Aispuro Hernández 3, María A. Islas-Osuna 1. 1 Laboratorio de Genética y Biología Molecular de Plantas, 2 Laboratorio de Proteínas Recombinantes, 3 Laboratorio de Fisiología Vegetal, Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo, A. C.

22B

Structural study of allergens present in manufactured latex gloves Christian Galicia Díaz Santana, Guillermo Mendoza Hernández, José Federico del Río Portilla, Adela Rodríguez Romero. Instituto de Química, UNAM.

23B

Energetic basis of the recognition of Bcr-Abl tyrosine kinase to adenosine nucleotides and its competitive inhibitor Imatinib (STI-571) Manuel B. García-Curiel, Axel Luviano-Jardon, Enrique García-Hernández. Department of Chemistry of Biomacromolecules, Institute of Chemistry, UNAM.

24B

Study of the conformational changes of the Mdm2 protein depending of the phosphorylation state Karla García, Vanesa Olivares. Laboratorio de interacciones biomoleculares y cáncer, Instituto de Física. UASLP.

25B

Kinetic stability of Triosephosphate isomerase from Schizosaccharomyces pombe Georgina Garza-Ramos and Alma Jessica Díaz-Salazar. Lab. Fisicoquímica e Ingeniería de Proteínas. Departamento de Bioquímica, Facultad de Medicina, Universidad Nacional Autónoma de México.

26B

NMR studies on immunoglobulin lambda 3 light-chain fibril formation Paloma Gil-Rodríguez1, Roberto Maya-Martinez, Nina Pastor and Carlos Amero2. Centro de investigaciones Químicas, Universidad Autónoma del Estado de Morelos.

27B

Studies of the Litopenaeus vannamei Thioredoxin by Nuclear Magnetic Resonance Hugo A. Gómez Uribe, Paloma C. Gil Rodríguez, Carlos Amero Tello, Centro de Investigaciones Químicas, Laboratorio de Bioquímica y Resonancia Magnética Nuclear, UAEM.

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28B

Models of pores formed by oligomers of variable domains of antibody light chains as possible cytotoxic species Diego S. Granados1, César Millán-Pacheco2, Nina Pastor2. 1Unidad Profesional Interdisciplinaria de Ingeniería, IPN Guanajuato. 2Facultad de Ciencias, UAEMor.

29B

Self-assembly of a chimeric protein into virus-like particles displaying lipase activity Isabel Alejandra Gutiérrez Landa, Ismael Bustos Jaimes. Laboratorio de Fisicoquímica e Ingeniería de Proteínas, Departamento de Bioquímica, Facultad de Medicina, Universidad Nacional Autónoma de México.

30B

Salmonella Phage P22 Tailspike-C-Terminus is an Intra-Molecular Chaperone that Assists Assembly of the Triple B-helical Protein Cameron Haase-Pettingell, Takumi Takata, and Jonathan King. MIT.

31B

The role of Thr120 in the K+-dependent pyruvate kinase family Gloria Herández-Alcántara, Carlos Guerrero-Mendiola, Leticia Ramírez-Silva. Departamento de Bioquímica, Facultad de Medicina, UNAM.

32B

The effect of swapping the backbone handedness and flipping the peptide plane on protein folding Joel Ireta. Departamento de Química, Universidad Autónoma Metropolitana-Iztapalapa.

33B

Construction by chemical conjugation of an immunotoxin containing the ribosomeinactivating protein curcin, and the anti-HER2 monoclonal antibody Lidia P. Jaramillo1, Andrés Romero2, Alma L. Martínez3. 1CIBA-IPN. 2FES Cuautitlán, UNAM. 3 CEPROBI-IPN.

34B

Zo-peroxidase: crystal structure and sequence of a highly glycosylated peroxidase resistant to hydrogen peroxide from japanese radish Nizaá Jiménez-Arroyo, Paloma Gil-Rodríguez, Sonia P. Rojas-Trejo, Brenda Valderrama, Enrique Rudiño-Piñera. Departamento de Medicina Molecular y Bioprocesos, Instituto de Biotecnología, UNAM.

35B

Structural studies of the influenza virus neuraminidase: searching for a second binding site to sialic acid Juárez Martínez Ariadna B1,2, Rudiño Piñera Enrique1. 1Departamento de Medicina Molecular y Bioprocesos. Instituto de Biotecnología, UNAM. 2Facultad de Ciencias, UAEM.

36B

Conformational plasticity of ankyrin repeat domain of transcient receptor potential vanilloid 1 (ARD-TRPV1) ion channel in complex with cysteine reactive agonist allicin Ernesto Ladrón-de-Guevara1, Jorge Romero-Estrada1, Margarita Romero-Ávila2, Gisela RangelYescas1, Leon D Islas1. 1Departamento de Fisiología, Facultad de Medicina, UNAM. 2 Departamento de Química Organica. Facultad de Química. UNAM.

37B

The hidden energetics of ligand binding to Wheat Germ Agglutinin Eduardo Leyva-Hernández, Enrique García-Hernández, Jorge L. Medrano-Cerano, Patricia Cano-Sánchez, Itzel L. González. Departamento de Química de Biomacromoléculas, Instituto de Química, UNAM.

38B

Structural characterization of three Triosephosphate isomerase (TIM) enzyme isoforms from Arabidopsis thaliana Margarita López-Castillo1, Robert Winkler1, Luis G. Brieba de Castro2.1Departamento de Biotecmología y Bioquímica, Cinvestav-Irapuato. 2Cinvestav-LANGEBIO.

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39B

Determination of different enolases expression in Trichomonas vaginalis Marisol López-Hidalgo1, Elibeth Mirasol-Meléndez1, Elisa E. Figueroa-Angulo2, Rossana ArroyoVerástegui2, Claudia G. Benítez-Cardoza1. 1Laboratorio de Investigación Bioquímica, Escuela Nacional de Medicina y Homeopatía, IPN. 2Departamento de Infectómica y Patogénesis Molecular, Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del IPN.

40B

Crystal structure of shrimp arginine kinase in binary complex with arginine Alonso A. López-Zavala1, Rogerio R. Sotelo-Mundo 1, Enrique Rudiño-Piñera2. Laboratorio de Bioquímica de Proteínas Recombinantes, Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo, (CIAD). 2Departamento de Medicina Molecular y Bioprocesos, (IBT-UNAM).

41B

Interactions of DPPC liposomes with two TIM proteins Miguel Magaña and Miguel Costas. Laboratorio de Biofisicoquímica, Departamento de Fisicoquímica, Facultad de Química, UNAM.

42B

Identification of IgG and IgE binding epitopes on Profilin (Hev b 8) from Hevea brasiliensis José Israel Mares-Mejía, Enrique Ortega-Soto, Adela Rodríguez-Romero. Instituto de Química, e Instituto de Investigaciones Biomédicas, UNAM.

43B

Dynamic and structural effects of cumulative mutations on the variable domain of the lambda 3r germline immunoglobulin light chain Liliana Martínez-Ávila, César Millán-Pacheco, Nina Pastor. Facultad de Ciencias, UAEMor.

44B

Study of the protease-prosegment electrostatic interactions in natural and chimerical complexes of Cathepsins K, L and S Juan Carlos Martínez-Hernández1, Iris N. Serratos-Álvarez1, Arturo Rojo-Domínguez2 y A. Jaqueline Padilla-Zúñiga1. 1 Departamento de Química, Universidad Autónoma MetropolitanaIztapalapa 2 Departamento de Ciencias Naturales, UAM-Cuajimalpa 2

45B

Proteomic and structural analysis of the enolases of Trichomonas vaginalis Elibeth Mirasol Meléndez1, Claudia Guadalupe Benítez Cardoza1, Luis Gabriel Brieba de Castro2, Rossana Arroyo Verástegui3, Absalom Zamorano Carrillo1. 1Laboratorio de Investigación Bioquímica, Escuela Nacional de Medicina y Homeopatía, Instituto Politécnico Nacional, 2 LANGEBIO, CINVESTAV-Irapuato, 3Departamento de Infectómica y patogénesis molecular, CINVESTAV.

46B

Structure and biochemical characterization of Lactobacillus plantarum Beta-fructosidase E. Omar Mendoza-Llerenas1, Vrani Ibarra-Junquera1, Pilar Escalante-Minakata1, Juan A. OsunaCastro3, Giuseppe Spano4, Daniela Fiocco5. 1Facultad de Química, Universidad de Colima (U d C). 2Facultad de Ingeniería Civil, U de C. 3Facultad de Ciencias Biológicas y Agropecuarias, U de C. 4Department of Food Science, (FU). 5Department of Biomedical Science, FU.

47B

Entamoeba histolytica: the oxidative folding of chitinase is assisted by the 38-kDa protein disulfide isomerase Alexis Z. Minchaca, Rosa E. Mares, Marco A. Ramos. Laboratorio de Biotecnología, Facultad de Ciencias Químicas e Ingeniería, Universidad Autónoma de Baja California.

48B

Bioinformatics analysis of the interaction among ehcpadh112 protein of Entamoeba histolytica with tight juntion proteins of epithelial cells Maricela-Montaño1, Abigail-Betanzos1, Mario-Rodriguez1, Michael- Schnoor1, José-Correa2, and Esther-Orozco1,. 1Centro de investigación y de estudios avanzados, 2Escuela Superior de Medicina-IPN.

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49B

Effect of guanidine hydrochloride on activity and stability of the amoebic chitinase Patricia L.A. Muñoz, Rosa E. Mares, Marco A. Ramos. Laboratorio de Biotecnología, Facultad de Ciencias Químicas e Ingeniería, Universidad Autónoma de Baja California.

50B

Alternative splice variants in TIM barrel proteins from human genome correlate with the structural modularity of this versatile protein fold Adrián Ochoa-Leyva1, Gabriela Montero-Morán2, Gloria Saab-Rincón3, Luis G. Brieba2 and Xavier Soberón1,3. 1INMEGEN-México, 2Langebio-CINVESTAV, 3IBT-UNAM.

51B

Linoleic acid isomerases in Lactobacillus plantarum. A multi-enzyme system that produces a bioactive conjugated linoleic acid isomer Joanna Ortega-Anaya, Alejandra Hernández-Santoyo. Departamento de Química de Biomacromoléculas, Instituto de Química, UNAM.

52B

Modeling the interaction between the α and β 1 subunits of the sodium channel Nav 1.4 Paiz B1; Scior T1; Islas A2; Millán L3; Salinas-Stefanon E2. 1Facultad de Ciencias Químicas, BUAP. 2Laboratorio de Biofísica cardiaca, Instituto de Fisiología, BUAP. 3Centro de Química, Instituto de Ciencias, BUAP.

53B

Inhibition of amyloid fibril formation of hen egg lysozyme Laura García Alvarado1, Mariana Peimbert1, Hugo Nájera 1. 1Departamento de Ciencias Naturales, Universidad Autónoma Metropolitana Cuajimalpa.

54B

In silico study on the selectivity of new silicon containing ibuprofen derivatives towards ciclo-oxygenase 1 and 2 David Pérez-Gómez1, Irene Díaz-Reval2, Fernando Obledo-Benicio1, Zeferino Gómez-Sandoval1, Rodrigo Razo-Hernández1, César Millán-Pacheco3, Nina Pastor3, Uzma I. Zakai4, Robert West4, and Ángel Ramos-Organillo1*. 1Facultad de Ciencias Químicas, UCOL. 2Centro Universitario de Investigaciones Biomédicas, UCOL. 3Facultad de Ciencias, UAEMOR. 4Organosilicon Research Center, Department of Chemistry, University of Wisconsin-Madison.

55B

Unolding Mechanism Study for Human Triose Phosphate Isomearase Carolina Perusquía Hernández, Dra. Gloria Saab Rincón. Departamento Ingeniería Celular y Biocatálisis, Instituto de Biotecnología (UNAM).

56B

Binding study of antiinflammatory cycloartanes to COX-2 Ramírez-Cisneros M. Angeles, Aguilar-Guadarrama A. Berenice, Domínguez Blanca E. Centro de Investigaciones Químicas, Universidad Autónoma del Estado de Morelos.

57B

Interaction study of aminopyrimidine inhibitors with the JNK3 protein by MM-PBSA Rodrigo S. Razo-Hernández1, Cesar Millán-Pacheco2, Manuel Villanueva-García3, Nina Pastor2, Zeferino Gómez-Sandoval1. 1Facultad de Química, UCOL. 2Facultad de Ciencias, UAEMor. 3 Asociación de Jubilados, UG.

58B

Identification of structural changes on the bovine superoxide dismutase protein (Bos taurus) by molecular dynamics simulation Lourdes Reyes-Cervantes1, Ponciano García-Gutiérrez2, Benjamín Ibarra-Tandi1, Jorge LópezLemus1, Roberto López-Rendón1. 1Facultad de Ciencias, Universidad Autónoma del Estado de México. 2Depto. de Química, Universidad Autónoma Metropolitana-Iztapalapa.

59B

Obtaining a VH fragment homodimer of the catalytic antibody 1F7, using prephenate dehydrogenase as a dimerization reporter Perla Rios-Flores, Joel Osuna. Depto. de Ingeniería Celular y Biocatálisis, IBT-UNAM.

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60B

Redox chemistry of the high affinity copper binding site in alpha-synuclein: Evaluating the role of methionines Esaú-E. Rodríguez1, Lidia G. Trujano-Ortiz1, Andrés Binolfi2, Claudio O. Fernández2, Felipe González1, Liliana Quintanar1. 1Departamento de Química, Cinvestav. 2IBR, CONICET, Universidad Nacional de Rosario.

61B

Interface design of enzyme Triosephosphate isomerase Karla Rojas-Méndez1 & Luis G Brieba1. 1Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad, Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del IPN.

62B

MD simulation of tau protein aggregation using DPD Jorge L. Rosas-Trigueros1,2, Alberto Vela1. 1Departamento de Química, Cinvestav. 2Laboratorio Transdisciplinario de Investigación en Sistemas Evolutivos, SEPI-ESCOM-IPN.

63B

Molecular dynamics study of the potential targets for the development of anti-obesity drugs GIP and GIPR Jonatan H. Sánchez-Alvarez1, Ángel Rivera-Delgado1, Irene Mendoza-Lujambio2, Jesús I. Murillo-Álvarez3, Eleazar Lara-Padilla2, Miriam Pescador-Rojas4, Jorge L. Rosas-Trigueros1, Rosaura Palma-Orozco. 1Laboratorio Transdisciplinario de Investigación en Sistemas Evolutivos, SEPI-ESCOM-IPN. 2Escuela Superior de Medicina, ESM-IPN. 3Centro Interdisciplinario de Ciencias Marinas, CICIMAR-IPN. 4Departamento de Ciencias de la Computación, ESCOM-IPN.

64B

The Saccharomyces cerevisiae mitochondrial DNA polymerase and interaction Eugenia Sánchez-Sandoval, Corina Díaz-Quezada y Luis Gabriel Brieba de Castro. Cinvestav.

65B

Physicochemical characterization of two eukaryotic ancestors of the enzyme triosephosphate isomerase Mariana Schulte-Sasse Jiménez1, Nancy Pulido Mayorga1, Miguel Costas Basín2, Enrique García Hernández3 and D. Alejandro Fernández-Velasco1. 1Facultad de Medicina, 2Facultad de Química and 3Instituto de Química, Universidad Nacional Autónoma de México.

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Crystal structure of the triose phosphate isomerase (TIM) from shrimp Litopenaeus vannamei Rogerio Sotelo-Mundo 1, J. Salvador Carrasco-Miranda 1, Cesar Cardona-Felix 2, Alonso LópezZavala 1, Luis G. Brieba 2, Enrique Rudiño-Piñera 3. 1 Laboratorio de Bioquímica de Proteínas Recombinantes. Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo, A.C. 2LANGEBIO, Cinvestav-Irapuato. 3 Departamento de Medicina Molecular y Bioprocesos, IBT-UNAM.

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Enhancement of the alcoholytic activity of the α-amylase AmyA from Thermotoga maritima MSB8 (DSM 3109) via directed evolution Simon Strompen, Juanita Damián-Almazo, Rodrigo Arreola, Edmundo Castillo and Gloria SaabRincon. Instituto de Biotecnología, UNAM.

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Functional characterization of recombinant mannosyltransferases synthesized in Pichia pastoris Nahúm Valente Hernández, Héctor Manuel Mora Montes*. Departamento de Biología, División de Ciencias Naturales y Exactas, Universidad de Guanajuato.

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The pH in the structure, stability and fibrillogenesis of a model amyloidogenic protein Ma. Isabel Velázquez López1, Yazmín Frías Lucio1, Héctor Ceceña Álvarez1, Roberto Maya Martínez3, Carlos Amero3, Miguel Costas Basín2, Nina Pastor4, y D. Alejandro Fernández Velasco1. 1Facultad de Medicina, 2Facultad de Química, UNAM, 3Centro de Investigaciones Químicas, 4Facultad de Ciencias, UAEMor.

3rd USA-Mexico Workshop in Biological Chemistry Cuarto Congreso de Rama de Fisicoquímica, Estructura y Diseño de Proteínas de la SMB Program page 27

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Calorimetric study of protein-protein interactions María Teresa Vieyra Eusebio and Miguel Costas. Laboratorio de Bio-fisicoquimica. Departamento de Fisicoquímica, Facultad de Química, Universidad Nacional Autónoma de México.

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Improved specificity in the search for new drugs targeting HpENO by means of structural alignment Astrid E. Viveros-Pedraza1, Laura Reyes-Ortega1, José Correa-Basurto2, Absalom ZamoranoCarrillo3, Claudia Benítez-Cardoza3, Miriam Pescador-Rojas4, Rosaura Palma-Orozco1, Jorge L. Rosas-Trigueros1. 1Laboratorio Transdisciplinario de Investigación en Sistemas Evolutivos, SEPIESCOM-IPN. 2Escuela Superior de Medicina IPN. 3Escuela Nacional de Medicina y Homeopatía IPN. 4Departamento de Ciencias de la Computación IPN.

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Spectroscopic study on the interaction of cysteine protease ppEhCP-B9 with sodium dodecyl sulfate Olga Zamudio-Prieto1, Claudia Benitez-Cardoza2, Jaime Ortega-Lopez1. 1Departamento de Biotecnología, Centro de Investigación y de Estudios Avanzados. 2Escuela Nacional de Medicina y Homeopatía, IPN.

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Interaction of the receptor for advanced-glycation-endproducts (RAGE) with HMGB1 and S100B proteins Iris N. Serratos1, Ambar López-Macay2, Nina Pastor3, César Millán-Pacheco3, Nallely Cabrera4, Ruy Pérez Montfort4, Karina Martínez-Flores2 and Alberto López-Reyes2 .1Departamento de Química, Universidad Autónoma Metropolitana-Iztapalapa. 2Laboratorio de Líquido Sinovial, Instituto Nacional de Rehabilitación. 3Facultad de Ciencias, Universidad Autónoma del Estado de Morelos. 4Instituto de Fisiología Celular. Universidad Nacional Autónoma de México.

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Strategies for stabilizing Triosephosphate isomerases of Trichomonas vaginalis (TvTIM1) via crosslinking reactions Ma.Eugenia Cruces Ángeles1,2, Priscila Estrella Hernández1, Claudia G. Benítez Cardoza2, Luis G. Brieba Castro1. 1Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad, Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del IPN. 2Laboratorio de Investigación Bioquímica, Programa Institucional en Biomedicina.

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Alternative structural solutions to iron-sulfur cluster in MutY DNA Glycosylase Yardena M. García-Salcedo, Corina E. Díaz-Quezada, Carlos Trasviña-Arenas. Luis G. Briebade Castro. Cinvestav. Unidad Irapuato.

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Structural stability acidic subunit amaranth by bioactive peptides insertion Jocksan Ismael Morales-Camacho, Silvia Luna-Suárez. CIBA - Instituto Politécnico Nacional.

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Is natural ethanol availability involved in the origin of alcohol- and aldehydedehydrogenases in animals Riveros-Rosas, Héctor; Julián-Sánchez, Adriana; Hernández-Tobías, Aída; Vara-Cisneros, Paola and Piña, Enrique. Depto. Bioquímica, Fac. Medicina, Universidad Nacional Autónoma de México.

3rd USA-Mexico Workshop in Biological Chemistry Cuarto Congreso de Rama de Fisicoquímica, Estructura y Diseño de Proteínas de la SMB Program page 28

Organizing Committee and Sponsors

Organizing Committee:

Gloria Saab Rincón, UNAM D. Alejandro Fernández Velasco, UNAM Liliana Quintanar, Cinvestav Silvia Cavagnero, U. of Wisconsin-Madison Marina Ramírez-Alvarado, Mayo Clinic Edgar Vázquez Contreras, UAM Joel Ireta, UAM Hugo Nájera, UAM Local Organizing Committee: Luis Brieba, Cinvestav Robert Winkler, Cinvestav

3rd USA-Mexico Workshop in Biological Chemistry Cuarto Congreso de Rama de Fisicoquímica, Estructura y Diseño de Proteínas de la SMB Program page 29

Sponsors: This event is funded by the following institutions: Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (CONACYT) Instituto de Biotecnología, UNAM Facultad de Medicina, UNAM Universidad Autónoma Metropolitana (UAM) Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del IPN (Cinvestav) Instituto de Investigación Biomédica Básica, UNAM

THE

PROTEIN SOCIETY

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