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Grupo de Computaci´on Cient´ıfica y Programaci´on Paralela Universidad de Murcia

http://www.um.es/pcgum/

Presentaci´ on L´ıneas de Investigaci´ on, M´ aster de Bioinform´ atica, Universidad de Murcia, noviembre 2013

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Contenidos

1

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2

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3

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4

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6 doctores + 4 no doctores Doctores Universidad de Murcia 3 Doctores Universidad Miguel Hern´andez 2 Doctores Universidad Polit´ecnica de Cartagena 1 Haciendo tesis doctoral 3 Haciendo tesis de m´aster (inform´atica) 4 Haciendo proyecto fin de grado 1 Publicaciones: http://dis.um.es/~domingo/investigacion.html

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Computaci´on cient´ıfica: integraci´ on de modelos con t´ecnicas computacionales para soluci´ on de problemas complejos, con grandes vol´ umenes de datos y/o necesidades de computaci´on.

Modelos: Matemáticos Estadísticos Físicos ... Computación: Ciencia: Numérica Medicina Estadística Farmacia Heurística Biología Algoritmos Química Paralela Física ... Ingenierías ...

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Modelado matem´atico y estad´ıstico Desarrollo de algoritmos eficientes M´etodos aproximados, metaheur´ısticas Paralelismo Modelado del tiempo de ejecuci´ on, Optimizaci´on y autooptimizaci´ on Aplicaci´ on a: algoritmos, esquemas algor´ıtmicos, aplicaciones Adaptaci´ on a: multicores, redes de ordenadores, GPUs...

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Aproximadamente 17, de las cuales 6 medicina-qu´ımica-biolog´ıa

Electromagnetismo: paralelismo, metaheur´ısticas, computaci´on matricial Econometr´ıa: estad´ıstica, paralelismo, metaheur´ısticas, computaci´on matricial Medicina: estad´ıstica, paralelismo, metaheur´ısticas Simulaci´on de mol´eculas: paralelismo, computaci´on matricial Dise˜ no de f´armacos: paralelismo, metaheur´ısticas

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Ejemplo: Preclampsia

Modelo estad´ıstico resuelto con algoritmos num´ericos matriciales. Aproximaci´on del mejor modelo con t´ecnicas de optimizaci´on metaheur´ısticas. Aceleraci´on de la resoluci´ on y aproximaci´ on del modelo con algoritmos matriciales paralelos. En sistemas multicore, cluster de ordenadores y supercomputador.

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Modelo estad´ıstico resuelto con algoritmos num´ericos matriciales. Aproximaci´on del mejor modelo con t´ecnicas de optimizaci´on metaheur´ısticas. Aceleraci´on de la resoluci´ on y aproximaci´ on del modelo con algoritmos matriciales paralelos. En sistemas multicore, cluster de ordenadores y supercomputador.

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Ejemplo: Preclampsia

Modelo estad´ıstico resuelto con algoritmos num´ericos matriciales. Aproximaci´on del mejor modelo con t´ecnicas de optimizaci´on metaheur´ısticas. Aceleraci´on de la resoluci´ on y aproximaci´ on del modelo con algoritmos matriciales paralelos. En sistemas multicore, cluster de ordenadores y supercomputador.

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Proyecto actual

Nacional: Mejora de Arquitectura de Servidores, Servicios y Aplicaciones Varios grupos de la Facultad de Inform´atica de Murcia (liderado por Manuel Acacio), y coordinado con Universidad Polit´ecnica de Valencia y Universidad de Castilla-La Mancha CCPP: Optimizaci´ on y autooptimizaci´ on de rutinas paralelas, y aplicaciones en ciencia e ingenier´ıa.

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Aplicaciones previstas en el proyecto Compresi´on y transmisi´ on de im´agenes 2D, 3D y v´ıdeo de cualquier especialidad m´edica: Historiales m´edicos. Problemas de almacenamiento de pruebas y diagn´osticos. Operaciones de cirug´ıa con asistencia remota. Extracci´on de comportamientos o caracter´ısticas de determinadas enfermedades para ayudar a su detecci´on o diagn´ostico. Atenci´on m´edica a trav´es de Internet. Soluci´on de problemas complejos con grandes vol´ umenes de datos y/o necesidades de computaci´ on: an´alisis de im´agenes, modelado estad´ıstico, an´alisis gen´ omico, simulaci´on de mol´eculas...

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Trabajos en curso (inici´andose) en temas de biolog´ıa-bioinform´atica

Simulaci´on de disoluci´ on de ´acido en est´ omago. Dentro de tesis doctoral sobre Desarrollo y optimizaci´ on de metaheur´ısticas paralelas parametrizadas y aplicaciones cient´ıficas. Metaheur´ısticas y paralelismo. Simulaciones moleculares. Dentro de tesis de m´aster. M´etodos num´ericos y paralelismo. Dise˜ no de f´armacos. Dentro de tesis de m´aster. Metaheur´ısticas y paralelismo.