Marcadores moleculares asociados a la calidad de la canal y la carne
Lic. Eileen Armstrong, MSc. PhD. Área Genética Facultad de Veterinaria
ADN molécula que contiene la información genética En TODAS las células del individuo (cromosomas). No cambia a lo largo de la vida del animal. Contiene los GENES. Gen: porción del ADN con la información necesaria para generar una determinada proteína.
Genoma: conjunto de ADN (con todos los genes) de una especie.
SNP • Polimorfismo de un solo nucleótido. • Cambia una base del ADN. • Genera variantes para un mismo gen. • Pueden estar dentro de genes o en otras regiones del ADN. • Marcador genético.
• Se conocen ya varios genes y SNPs relacionados al desarrollo y metabolismo del músculo y tejidos asociados (adiposo, conectivo). • Especialmente en bovinos, suinos y aves, pero también en ovinos. • Línea de investigación en Área Genética de la Facultad de Veterinaria: genética molecular de la calidad de la carne bovina y ovina.
• Objetivos: – contribuir a detectar esos genes y SNPs. – analizar cómo interactúan y cómo se asocian a características productivas. – posibilitar la selección de animales que tengan las mejores variantes genéticas.
Para eso se necesitan: • muestras de ADN de los animales
Mediante análisis estadísticos se detectan asociaciones
• datos productivos (peso vivo, área del ojo del bife, peso de canal, % de grasa, terneza, etc…)
Proyecto “Asociación de SNPs de genes candidatos con caracteres de calidad de la carne y la canal en ovinos”
• Análisis de 30 SNPs en genes específicos (análisis primario) Mediante análisis estadísticos se detectan asociaciones Proyecto en ejecución. Financiación: ANII
• Datos tomados de la Prueba de Progenie y Evaluación Genética Poblacional de Texel, así como de otras poblaciones ovinas.
• 42 carneros • 282 madres Otras razas y cruzas de razas carniceras: • 546 corderos de EEMAC
Características medidas en los corderos: Pre faena: • -ganancia diaria de peso • -pesos a diferentes edades y peso final vivo • -estado corporal • -área del ojo del bife y espesor de grasa por ultrasonido Post mortem: • -conformación de carcasa, medidas y compacidad • -peso de la canal caliente y fría • -dimensiones del L. dorsi y área del ojo de bife medidos en el rack • -espesor de grasa subcutánea • -peso cortes con hueso • -terneza instrumental • -panel de degustación (terneza, sabor, aceptabilidad) • -pH • -color de la carne y la grasa • -cantidad de grasa intramuscular
Base de datos muy valiosa para la investigación!
BANCO DE ADN • Extracción de ADN genómico de sangre y músculo. • Banco: en el Área Genética de F.Vet y en INIA • 1322 muestras de ADN (en procesamiento) • Además: muestras de carne congelada y en alcohol (respaldos). • Cada muestra perfectamente identificada con el ID del animal y sus datos.
Genes a analizar en esta etapa • • • • • • • • •
CAPN1 (calpaína; proteólisis de fibras musculares, terneza) LEPTINA (hormona del apetito; engorde) GH y GHR (hormona de crecimiento y receptor; desarrollo corporal) CAST (calpastatina; proteólisis de fibras musculares, terneza) FABP9 (fatty acid binding protein 9; metabolismo lipídico y engorde) FABP4 (fatty acid binding protein 4; metabolismo lipídico y engorde) IGF1 (insulin growth factor 1; desarrollo corporal y engorde) GDF8 (growth differentiation factor 8; miostatina, desarrollo muscular) (entre otros)
• Selección de SNPs en estos genes, basándonos en datos de la secuenciación del genoma ovino.
Base de datos Genoma Ovino • Genoma de referencia: Texel
Ya contamos con: • Fenotipos (mediciones en los animales) • Muestras de ADN de 814 animales (banco, el cual sigue aumentando) Próximamente: genotipado de SNPs en los genes mencionados en el total de muestras del banco y análisis estadísticos de asociación genotipo-fenotipo.
Resultados esperados: • Detección de genes asociados a calidad de la carne y la canal ovina. • Validación de marcadores (genes) presentes en kits comerciales. • Posibilidad de implementar Selección Asistida por Marcadores para aumentar progreso genético.
Proyecciones • Genotipado masivo del genoma (mismos animales del banco de ADN, con datos fenotípicos). • Chip 700k (aprox. 700.000 SNPs; en construcción) • Estudio global de genes asociados a calidad de la carne. • Generar información útil para posible selección genómica? Objetivos finales: • Mejorar calidad de la canal y la carne ovina. • Aumentar valor agregado del producto y de los reproductores.
“Asociación de SNPs de genes candidatos con caracteres de calidad de la carne y la canal en ovinos” Facultad de Veterinaria INIA SUL Facultad de Agronomía Scottish Agricultural College Sociedad de Criadores de Texel del Uruguay Financiación: Fondo InnovAgro - Agencia Nacional de Investigación e Innovación (ANII), INIA. Duración: febrero 2011 a febrero 2013.