Revisado: 11 de agosto de 2014 Por: Juan S. Ramírez Lugo, Ph.D.

Primer Semestre 2014-2015 I.

Título del Curso:

Bioquímica de la Célula

II. Codificación:

BIOL 4545

III. Horario:

Lunes y Viernes: 11:00 AM –12:20 PM

IV. Salón:

CN-340

V. Créditos:

3

VI. Pre-requisitos:

BIOL 3349, QUIM 3031

VII. Libro de Texto: Nelson, D.L. and Cox M.M. (2008). Lehninger: Principles of Biochemistry. Fifth edition. New York, NY: W.H. Freeman and Company. Libros de referencia: 1. Berg J.M., Tymoczko J. L., and Stryer L. (2002). Biochemistry. Fifth edition. New York, NY: W.H. Freeman and Company. 2. Voet D. and Voet J.G. (2004) Biochemistry. Third edition. New York, NY: J. Wiley & Sons. 3. Alberts B., et al. (2002) Molecular Biology of the Cell. Fourth Edition. New York, NY: Garland Science. 4. Capra F. and Luisi P.L. (2014) The Systems View of Life: A Unifying Vision. First Edition. New York, NY: Cambridge University Press. VIII. Descripción del curso: Este curso tiene como objetivo principal presentar una visión holística de conceptos fundamentales relacionados a las moléculas e interacciones que se requieren para mantener a la célula en un estado de equilibrio estable y dinámico. A través del análisis crítico de conceptos establecidos y estudios mas recientes enfocados en proteínas, lípidos y carbohidratos, el estudiante se familiarizará con la relación entre la forma y la función de estas macromoleculas, las redes dinámicas formadas por interacciones entre las mismas, el flujo de información a través de esta redes y las transformaciones de energía que aseguran la homeostasis celular. En adición, se presentaran conceptos de cómo estas moléculas y procesos han cambiado y/o se han conservado a lo largo de la evolución biológica. El curso también presentará una introducción a las propiedades generales de organización a partir de membranas celulares, la regulación metabólica de estos procesos a nivel de organismo y las técnicas experimentales utilizadas para el análisis de estas macromoléculas.

UNIVERSIDAD DE PUERTO RICO Recinto de Río Piedras Facultad de Ciencias Naturales Departamento de Biología IX. Objetivos de aprendizaje: 1. Entender los principios de los procesos moleculares y la red de interacciones que regulan el metabolismo de un organismo, incluyendo poder describir, comparar y contrastar los procesos de transformaciones energéticas incluyendo glucólisis, gluconeogénesis, ciclo del ácido cítrico, transporte de electrones, fosforilación oxidativa y fotosíntesis. 2. Entender y aplicar los fundamentos de los mecanismos, la cinética y la regulación de las reacciones catalizadas por enzimas. 3. Demostrar conocimiento de la nomenclatura, composición química y física, estructuras y funciones principales de las proteínas, lípidos y carbohidratos. 4. Demostrar conocimiento sobre las fuerzas intramoleculares e intermoleculares que determinan la forma y la función de las proteínas, lípidos y carbohidratos. 5. Comprender conceptos generales, propiedades y patrones de organización de las membranas celulares. 6. Evaluar los métodos de aislamiento, purificación y síntesis utilizados en el estudio de proteínas, lípidos y carbohidratos. X. Itinerario de Clases (Sujeto a cambios) A. Moléculas Biológicas: Forma, Función y Caracterización Fecha

Tópico

Capítulo

11 agosto

Introducción; Agua, pH

1–2

15 agosto

Amino Ácidos, Péptidos

3

18 agosto

Estructura Primaria y Secundaria

3–4

22 agosto

Estructura Terciaria y Cuaternaria

4

25 agosto

Análisis de Proteínas

3

Examen 1

29 agosto

Función Proteica

1 septiembre

5

FERIADO

5 septiembre

Función Proteica

5

8 septiembre

Enzimología

6

12 septiembre

Enzimología

6

15 septiembre

Enzimología

6

Examen 2

19 septiembre

Carbohidratos

7

22 septiembre

Carbohidratos

7

2

UNIVERSIDAD DE PUERTO RICO Recinto de Río Piedras Facultad de Ciencias Naturales Departamento de Biología 26 septiembre

Lípidos

10

29 septiembre

Lípidos

10

3 octubre

Membranas

11

6 octubre

Membranas

11

Examen 3

B. Bioenergética y Metabolismo Fecha

Tópico

Capítulo

10 octubre

Bioenergética y Reacciones Bioquímicas

13

13 octubre

FERIADO

17 octubre

Metabolismo de Carbohidratos

14

20 octubre

Metabolismo de Carbohidratos

14

24 octubre 27 octubre 31 octubre 3 noviembre

Principios de Regulación Metabólica y Ciclo de Ácido Cítrico Principios de Regulación Metabólica y Ciclo de Ácido Cítrico Síntesis de ATP: Fosforilación Oxidativa Síntesis de ATP: Fosforilación Oxidativa

15–16 15–16 19 19

Examen 4

7 noviembre

Catabolismo: Ácidos grasos

17

10 noviembre

Catabolismo: Ácidos grasos

17

14 noviembre 17 noviembre 21 noviembre 24 noviembre 28 noviembre 1 diciembre

Catabolismo: Amino Ácidos, Ciclo de Urea Catabolismo: Amino Ácidos, Ciclo de Urea Regulación Hormonal e Integración del Metabolismo Regulación Hormonal e Integración del Metabolismo FERIADO Regulación Hormonal e Integración del Metabolismo Examen Final

3

18 18 23 23

23

UNIVERSIDAD DE PUERTO RICO Recinto de Río Piedras Facultad de Ciencias Naturales Departamento de Biología XI. Fechas asignadas para exámenes: PRIMER EXAMEN PARCIAL – Miércoles, 3 de septiembre del 2014 Material de Capítulos 1–4 SEGUNDO EXAMEN PARCIAL – Miércoles, 24 de septiembre del 2014 Material de Capítulos 5–6 TERCER EXAMEN PARCIAL – Miércoles, 15 de octubre del 2014 Material de Capítulos 7, 10–11 CUARTO EXAMEN PARCIAL – Miércoles, 12 de noviembre del 2014 Material de Capítulos 13–16, 19 TODOS LOS EXÁMENES PARCIALES SERÁN DE 5:30–7:30 PM EN LOS SALONES CN-339 Y CN-340. (4:30–7:30 PM PARA ESTUDIANTES DE HORARIO DE CONFLICTO Y ACOMODO RAZONABLE) EXAMEN FINAL – fecha y hora asignada por Registrador. El examen final será comprensivo e incluye una sección parcial del material de Capítulos 17–18, 23 XII. Estrategias de instrucción: Conferencias, discusiones grupales, dinámicas interactivas, estudio independiente, lecturas asignadas, exámenes, pruebas cortas y otras tareas XIII. Recursos de aprendizaje o instalaciones mínimas disponibles o requeridos: Acceso a una computadora, acceso a Internet, cuenta de correo electrónico, cuenta de Blackboard, libro de texto y referencias. XIV. Materiales del Curso: Las presentaciones del Profesor, artículos científicos, documentos de apoyo y videos educativos e ilustrativos estarán disponible para los estudiantes a través de Blackboard. Las presentaciones del profesor estarán disponibles luego de la clase. XV. Estrategia de evaluación: Instrumento de Evaluación

Puntos

Porcentaje

Quizzes, Tareas, Actividades y Participación

80 Puntos

13.34%

Exámenes parciales (4)

100 puntos (400 Puntos)

16.67% (~66.67%)

Examen Final

120 puntos

20%

TOTAL

600 Pts.

100%

4

UNIVERSIDAD DE PUERTO RICO Recinto de Río Piedras Facultad de Ciencias Naturales Departamento de Biología XVI. Sistema de calificación A 100–90 % B 89–80 % C 79–70 % D 69–60 % F 59–0 % XVII. Información de el Profesor y Asistente de Cátedra: Profesor: Dr. Juan S. Ramírez Lugo Catedrático Auxiliar Oficina: NCN 210 Horas de Oficina: Miercoles, 10:00 – 12:00 AM* *Preferiblemente por previo acuerdo* Teléfono: 787-764-0000 ext. 4874 Correo electrónico: [email protected] Asistente de Cátedra: Sr. Rey Rosa - [email protected] XVIII. Derechos del estudiante: Los estudiantes que reciban servicios de rehabilitación vocacional deben comunicarse con el(la) profesor(a) al inicio del semestre para planificar el acomodo razonable y el equipo asistivo necesario conforme a las recomendaciones de la Oficina de Asuntos para las Personas con Impedimentos (OAPI) del Decanato de Estudiantes. También, aquellos estudiantes con necesidades especiales que requieran de algún tipo de asistencia o acomodo deben comunicarse con el(la) profesor(a). XIX. Reposiciones: NO HABRÁ REPOSICIÓN DE EXÁMENES PARCIALES. Si el estudiante no toma un examen parcial deberá presentar una excusa razonable que justifique su ausencia, preferiblemente una excusa médica o legal. En casos excepcionales con justificación y luego de presentar la excusa, el porcentaje de preguntas aprobadas en el examen final será la nota del examen al que se ausentó. De no presentar una excusa médica/legal/razonable recibirá el valor de cero para el examen parcial que no tomó. ES RESPONSABILIDAD DEL ESTUDIANTE asegurarse de obtener la nota de cualquier examen parcial tomado antes de tomar el próximo examen. EL EXAMEN FINAL (comprensivo) NO ES CONDICIONAL. 5

UNIVERSIDAD DE PUERTO RICO Recinto de Río Piedras Facultad de Ciencias Naturales Departamento de Biología NO HABRÁ REPOSICIÓN DE LAS EXPERIENCIAS DE LA CLASE, esto incluye las tareas llevadas a cabo en el salón y las pruebas que se lleven a cabo durante las horas de clase. De ausentarse a clase ES RESPONSABILIDAD DEL ESTUDIANTE obtener el material discutido durante ese periodo. XX. Advertencias: EL FRAUDE ACADÉMICO NO SERÁ TOLERADO EN NINGUNA FORMA. Cualquier fraude académico está sujeto a sanciones disciplinarias según descrito en el Reglamento General de Estudiantes de la Universidad de Puerto Rico. LA ASISTENCIA A CLASES ES COMPULSORIA tal como lo indica el Reglamento General de Estudiantes de la Universidad de Puerto Rico. La nota final puede afectarse por ausencias injustificadas y/o excesivas. Tanto el programa de clases como los procedimientos descritos anteriormente están SUJETOS A CAMBIOS en caso de circunstancias extraordinarias. Cualquier cambio que sea necesario será notificado con la debida anticipación.

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