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Microbiologia General Trimestre 16-P
5. Nutrición microbiana
nutrición Masa celular de un organismo (biomasa) formada casi en su totalidad por moléculas con 4 tipos de átomos:
Carbono (C), nitrógeno (N), oxígeno (O) e hidrógeno (H)
Otros elementos indispensables para el metabolismo:
P, K, Ca, Mg, S, Fe, Zn, Mn, Cu, Mo y Co
Agua: 80 - 90% del peso total de la biomasa principal componente (también aporta nutrientes: H y O)
Nutrientes: sustancias empleadas para la biosíntesis y producción de energía en TODOS los organismos vivos
Con base en la cantidad requerida para una célula, los nutrientes se dividen en:
Macronutrientes (C, H, O, N, P, S, K, Fe, Mg):
Necesarios en grandes cantidades
Primarios (g/L)
Secundarios (mg/L)
Micronutrientes o microelementos (Ca, Mn, Zn, Cu, Co y Mo):
~ 95% del peso seco de una célula
Necesarios en cantidades pequeñas mg por litro
Factores de crecimiento (mg por litro) Composición química de la célula indicador de los principales elementos necesarios para el crecimiento
macronutrientes Primarios (g/L) C, H, O, N, P, S BM*
(% bs)
Formas comunes
C
50
Inorg: CO2 Org: comp. org. (CHO)n
O
20
H2O, O2, (CHO)n
N
14
H
8
Inorg: NH4+, NO3-, NO2, N2 Org: aa, péptidos
P
3-5
PO42- (fosfatos)
1-3
SO42-, aa, H2S, sulfuros metálicos
S
H2O, (CHO)n
Función en la célula Componente estructural básico de los compuestos orgánicos
Componente del agua y biomoléculas. O2 aceptor final de ē en la respiración aerobia Constituyente de aminoácidos y nucleótidos Constituyente de compuestos orgánicos
En ácidos nucleicos, fosfolípidos, coenzimas y ATP Constituyente de aa (Cys, Met), vitaminas (tiamina, biotina), enlaces disulfuro (prots)
*Contenido en biomasa g/100 g BM seca
Macronutrientes (secundarios) Y MICRONUTRIENTES BM
K
(% bs)
Na
Mg Cl
Ca Fe
1.0
1.0
0.5
0.5
Formas comunes K+ (sales)
Na+ (sales) Mg2+ (sales) Cl- (sales)
0.2
Ca2+ (sales)
0.2
Fe2+ (sales)
Micronutrientes* (< 0.01%): Mn, Zn, Co, Cu, Mo, Ni, Se
Sales
Función en la célula Cofactor de enzimas, mantiene el balance eléctrico celular Transporte transmembrana, balance eléctrico Estabiliza ribosomas, membranas y ácidos nucléicos, cofactor de enzimas
Mantenimiento del balance eléctrico celular
Estabiliza la pared y endosporas bacterianas, cofactor de enzimas Componente de citocromos y ferroproteínas involucradas en el transporte de ē
Cofactores de enzimas, constituyentes de vitaminas y enzimas
* En general, sus requerimientos se conocen cualitativamente y varían en función de la fase de crecimiento se adicionan al medio en cantidades arbitrarias (µg/L)
FACTORES DE CRECIMIENTO Compuestos orgánicos esenciales (mg/L) que los organismos:
Necesitan como precursor o constituyente celular
No pueden sintetizar hay que agregarlos en el medio Tres tipos:
Bases nitrogenadas: purinas (A, G) y pirimidinas (C, T, U): síntesis de ácidos nucleicos Vitaminas: centros activos y cofactores de enzimas Aminoácidos: síntesis de proteínas peptonas
Hidrolizados proteicos péptidos, aa, minerales y micronutrientes
Peptona de soya, extracto de levadura y extracto de malta
5. Nutrición microbiana
CLASIFICACIÓN DE MICROORGANISMOS Requerimientos nutricionales de los microorganismos: Fuente de energía: para producción de ATP
Luz fotosíntesis
Oxidación de compuestos químicos
Fuente de electrones: donadores de ē para la biosíntesis
Compuestos orgánicos
Compuestos inorgánicos
Fuente de carbono: para el crecimiento
Compuestos orgánicos CO2
Tipos nutricionales
TIPOs NUTRICIONALES Tipo de nutrición
Fuente de energía
Donador de H+/ē
Fuente de carbono
Quimiótrofos
Química
-
-
Fotótrofos
Luz
-
-
Organótrofos
-
Litótrofos
-
Autótrofos
-
Heterótrofos
-
Comps. orgánicos
Comps. inorgánicos
-
Inorgánica (CO2) Orgánica (CHO)n
Fuente de energía
Luz -Foto-
Química -Quimio-
Donador de electrones Orgánico -organo-
Inorgánico -litoOrgánico -organoInorgánico -lito-
Fuente de carbono
Orgánica -heterótrofoCO2 -autótrofo-
Orgánica -heterótrofoCO2 -autótrofo-
Orgánica -heterótrofo-
Nombre Fotoorganoheterótrofo Fotoorganoautótrofo Fotolitoheterótrofo Fotolitoautótrofo Quimioorganoheterótrofo Quimiolitoheterótrofo
CLASIFICACIÓN DE MICROORGANISMOS Por ejemplo:
Organismo quimio-lito-heterótrofo
Fuente de E: Fuente de ē:
Fuente de C:
Química
Comp. inorgánico Comp. orgánico
Organismo foto-organo-autótrofo
Fuente de E:
Luz
Fuente de C:
CO2
Fuente de ē:
Comp. orgánico
Ser autótrofo es vida!
Heterótrofo
Heterótrofo
Heterótrofo
Yo uso luz para alimentarme H2S
CLASIFICACIÓN DE MICROORGANISMOS Tipo de nutrición Quimio-organoheterótrofos*
(fotoheterótrofos)
Quimio-litoautótrofos
(quimioautótrofos)
Foto-litoautótrofos*
(fotoautótrofos)
Fuente de carbono
Compuestos orgánicos
(azúcares, carbohidratos)
(quimioheterótrofos)
Foto-organoheterótrofos
Donador de ē
Fuente de energía
Compuestos orgánicos
Luz
(azúcares, carbohidratos, ácidos grasos, alcoholes)
Compuestos inorgánicos
(H2S, Fe , 2+
Luz
CH4, H2, NH4+, NO2)
NO3,
C. inorgánicos (S2-)
Ejemplos Hongos, bacterias patógenas, animales, protozoos Bacterias verdes que no oxidan azufre
Inorgánica (CO2)
Bacterias nitrificantes, muchas arqueas
Inorgánica (CO2)
Organismos fotosintéticos: cianobacterias, algas, plantas
* La mayoría de los organismos
De acuerdo con los balances, podemos saber el tipo de organismo: Foto-lito-autótrofo
6 CO2 + 6 H2O + Luz C6H12O6 + 6 O2
C6H12O6 + 6 O2 6 CO2 + 6 H2O
Quimio-organo-heterótrofo
6 CO2 + 6 H2S C6H12O6 + 6 S0
Quimio-lito-autótrofo
Otros tipos de microorganismos:
Mixótrofos: obtienen C a partir de compuestos orgánicos o inorgánicos
Auxótrofos: por una mutación en su genoma pierden la capacidad para sintetizar un nutriente esencial (comúnmente aa) requieren una fuente exógena del compuesto para crecer (factor de crecimiento)
Quimiolitoautótrofos varios tipos en función del donador inorgánico de ē que oxidan: Fuente ē Reacción de oxidación
H
H2 H2O
Fe
Fe2+ Fe3+
S
S0 + 1½O2 + H2O H2SO4
N
2NH4+ + 3O2 2NO2- + 4H+ + 2H2O 2 NO2+ + O2 2 NO3-
Ejemplo
Cupriavidus necator
Acidithiobacillus ferrooxidans
Bacterias del azufre: colonias en “respiraderos calientes”: H2S
M. mazei
Thiobacillus thiooxidans
B. nitrificantes: Nitrosomonas Nitrobacter
Arqueas metanógenas obtienen energía oxidando H2 y usan CO2 como aceptor de ē?: 4 H2 + CO2 CH4 () + 2 H2O ()
Methanosarcina mazei
Quimiolitoautótrofo E: química; ē: comp. inorg; C: CO2
Bacterias que oxidan Fe2+ para obtener energía
5. Nutrición microbiana
MEDIOS DE CULTIVO Es el material nutritivo en el que se pueden recuperar, multiplicar y aislar microorganismos
Provee los requerimientos para el cultivo de microorganismos en un laboratorio
Formulación de un medio de cultivo se basa en la composición química de una célula microbiana
PREPARACIÓN DE MEDIOS DE CULTIVO Agua destilada Fuentes de C (azúcares) y N (sales) Macronutrientes
Ajuste de pH
Micronutrientes
Esterilización
Factores de crecimiento (vitaminas, peptonas, extractos)
Agente solidificante
(15 lb/plg2, 15 min)
Inoculación Incubación
CLASIFICACIÓN DE MEDIOS DE CULTIVO Con base en sus características, los medios se clasifican en: Estado físico:
Composición:
Sólidos Líquidos Definidos (sintético) Complejos
Naturaleza de sus componentes: Propósitos de uso:
Mínimo Rico Selectivo Diferencial Enriquecimiento
Sintéticos Naturales
Estado físico Útiles para:
Sólidos llevan un agente solidificante
Aislamiento e identificación características de las colonias Agente solidificante más común y utilizado: agar (1 – 2%)
Polisacárido extraído de algas rojas: funde a ~100°C, gelifica a ~45°C La mayoría de los microorganismos no lo degrada
Líquidos sin agente solidificante Útiles para:
Recuperar y cuantificar la biomasa de un cultivo
Analizar el medio para detectar cambios en su composición (consumo/producción de un compuesto)
composición Sintéticos o químicamente definidos Se conoce la composición exacta de sus componentes (cantidad y calidad) Fuentes de C: azúcares lactosa, glucosa, sacarosa, almidón
Fuentes de otros elementos: sales NaNO3, (NH4)2SO4, NH4NO3
Usos: para estudios fisiológicos o descriptivos
Cuando se quieren resultados definidos y repetitivos
Para conocer los requerimientos nutricionales exactos de un microorganismo (efecto de la adición/eliminación de un compuesto)
composición Complejos o químicamente indefinidos Contenido conocido de ingredientes, pero al menos uno tiene composición desconocida (es químicamente indefinido) no se sabe su composición cualitativa ni cuantitativa Sustancias nutritivas fuente de C, N y energía
Fuentes de C: melazas, extracto de malta, celulosa, aceites Fuentes de N: peptonas (hidrolizados proteicos)
Vitaminas y péptidos: ext. de carne y levadura, infusión de cerebro
Usos: cuando se desconocen los requerimientos nutricionales contienen sustancias útiles para cualquier microorganismo
USO
Mínimo = químicamente definido
Aporta solo los nutrientes indispensables para el crecimiento de un organismo
Ejemplo: medio Czapek (pH 6.8) común para cultivo de hongos ¿El medio Czapek podría convertirse en medio rico? ¿Cómo?
Componente Sacarosa NaNO3
K2HPO4
Cantidad (g/L) 30.0
3.0 1.0
MgSO4.7H2O
0.5
FeSO4.7H2O
0.01
KCl
Agar*
0.5
15.0
Rico = químicamente indefinido Contiene nutrientes esenciales + compuestos que aportan fuentes complejas de nutrientes? aa, vitaminas, precursores de ácidos nucleicos
USO
Diferencial
Tiene indicadores que permiten diferenciar (a simple vista) entre grupos bacterianos por diferencias metabólicas generalmente cambio de color NO inhibe el desarrollo de otros microorganismos Usos: para diferenciar entre grupos microbianos
Ejemplo:
Medio agar-sangre: 5% sangre (caballo) capacidad de hemólisis bacterias hemolíticas y no hemolíticas (este medio también es rico) β-hemólisis en agar sangre
USO
Selectivo
Favorece el crecimiento de un grupo microbiano específico e inhibe el crecimiento de los no deseados: adición de compuestos Usos: principalmente aislamiento Ejemplos:
Ajuste de factores ambientales (pH, T) termófilos, acidófilos … Uso de CO2 como fuente de C autótrofos Celulosa selectivo para degradadores de celulosa
EMB: selectivo para Gram(-) el cristal violeta inhibe Gram(+)
USO
Selectivo-Diferencial
Agar MacConkey lactosa, peptonas, rojo neutro, sales biliares y cristal violeta Selectivo
No crecen bacterias Gram (+) por el cristal-violeta
No crecen algunas Gram (-) por las sales biliares [SB] (tensoactivos que desorganizan membranas)
Enterobacterias naturalmente crecen con SB (intestino)
Diferencial
Enterobacterias Lac(+) producen AO colonias rojas con halo (pp de SB)
Enterobacterias Lac(-) usan peptonas y excretan NH4+ colonias amarillas ( pH)
USO
Enriquecimiento
Contiene factores de crecimiento
Favorece el crecimiento de microorganismos que se encuentran en bajo número Usos: para la concentración de ciertos microorganismos
Ejemplos:
Adición de sangre, suero, extractos de tejidos animales y vegetales
Cultivo de enriquecimiento para microorganismos halófilos:
Alta concentración de sales (15% de NaCl) favorece el crecimiento de microorganismos halófilos e inhibe el de otros grupos